Introduction
Le TER Franche-Comté est le réseau de lignes TER qui couvre la région administrative Franche-Comté.
Depuis la convention signée en 2002, et pour une durée de 5 ans, entre Jean-François Humbert, président du conseil régional de Franche-Comté et Noël Belin, directeur régional de la SNCF, le conseil régional de Franche Comté est l'autorité organisatrice des transports régionaux. Une nouvelle convention, signée le 21 décembre 2006, par Raymond Forni, président du conseil régional de Franche-Comté et Josiane Beaud, directrice régionale de la SNCF, en présence d'Anne-Marie Idrac, présidente de la SNCF, couvre la période 2007-2012.