Clisson est traversée dans le sens nord-sud par la route départementale D763 entre Gorges et Cugand. La ligne de bus 270 du réseau Lila (réseau du Conseil Général de la Loire-Atlantique) dessert Clisson.
La Gare de Clisson est l'une des premières gares régionales desservie par les TER Pays de la Loire. Elle se trouve sur la Ligne Nantes - Saintes, dont le tronçon jusqu'à La Roche-sur-Yon vient d'être électrifiée. Ces travaux vont permettre la mise en place dès septembre 2010 d'une liaison tram-train vers la « Cité des Ducs », qui était prévue depuis plusieurs années et qui nécessitera quelques aménagements supplémentaires (notamment la mise au gabarit des quais de la gare). La gare est également le point de départ de la ligne en direction de Cholet.
Le Château de Clisson dont la construction a débuté au XIe siècle, s'est poursuivie au cours du XIIIe siècle,
Château de Clisson fait l'objet d'un classement au titre des monuments historiques depuis 1924.
La Garenne Valentin est une villa italienne construite de 1810 à 1827. La villa porte le nom de son propriétaire : Jacques-Charles Valentin. A l'origine, la bâtisse était un couvent bénédictin (incendié en 1794).
La Garenne Valentin fait l'objet d'un classement au titre des monuments historiques depuis 1997.
Domaine de la Garenne Lemot et sa villa (en réalité à Gétigné).
Le Parc Henri IV (en face de la Garenne Lemot) où le sculpteur Lemot y fait ériger une colonne surplombé du buste d'Henri IV.
La Chapelle des Templiers Cette église romane (fin du XIIe siècle) est un édifice Templier. Aujourd'hui le site accueille des expositions et des concerts.
La Chapelle des Templiers fait l'objet d'un classement au titre des monuments historiques depuis 1975.
L'église St-Jacques (XIIe siècle)
L'église St-Jacques fait l'objet d'un classement au titre des monuments historiques depuis 1941.
L'église Notre-Dame
L'église Notre Dame fait l'objet d'un classement au titre des monuments historiques depuis 2006.
L'église de la Trinité est à l'origine un prieuré bénédictin dépendant de l'Abbaye Saint-Jouin de Marnes et l'Abbayes de Saint Martin de Vertou.
L'église de la Trinité fait l'objet d'un classement au titre des monuments historiques depuis 1997.
Le Temple de l'Amitié. Temple inspiré du style grec antique de par son fronton triangulaire surmontant quatre colonnes doriques. François-Frédéric Lemot y est enterré.
Le Couvent des Cordeliers. Il est fondé par les Cordeliers au début du XVe siècle.
Autres patrimoines
Les Halles de Clisson
Pont de la Vallée sur la Sèvre datant du XVe siècle. Pont en granit présentant 6 voies d’eau et 5 arches de dimensions inégales.
Le Pont de la Vallée sur la Sèvres fait l'objet d'un classement au titre des monuments historiques depuis 1922.
Les Halles datant du XVe siècle (dans le centre, près du Château, qui accueille le marché tous les vendredis, et le mardi, petit marché aussi)
Les Halles fait l'objet d'un classement au titre des monuments historiques depuis 1923.
Le Moulin de Plessard (au fond du parc Henri IV), abritant le club de canoë-kayak et une école de danse