L’île, avec une longueur approximative de 34 kilomètres et une largeur régulière de 5 km en moyenne occupe une surface de 128 km². À proximité se trouvent deux îlets, le Judge and Clerk Islets d'une surface de 0,2 km² à 14 km au nord et le Bishop and Clerk Islets d'une surface de 0,6 km² à 34 km au sud. Ces îles forment le point le plus méridional de l'Australie.
Au XIXe siècle, on supposait l'existence d'une île plus au sud de Macquarie, l’île Emerald.
L'ensemble est la partie émergée d'une chaine et faille sous-marine à laquelle elle a donné son nom, la faille Macquarie, sur un axe sud-nord depuis la Nouvelle-Zélande.
La région est soumise à des tremblements de terre puissants. Ainsi le 23 décembre 2004, un tremblement de terre de magnitude 8,1 sur l'échelle de Richter (un des plus puissants jamais enregistrés) frappa l'île mais sans dégât majeur. Le 12 avril 2008, un tremblement de terre de 7,1 de magnitude se produisit sur la faille, non loin de l'île Macquarie.
Ile Macquarie a un climat de type DM (Subpolaire Océanique (Ou océanique froid)) avec comme record de chaleur 14.3 °C le 18/3/2001 et comme record de froid -9.4 °C le 3/7/2003. La température moyenne annuelle est de 4.9 °C.
mois | jan. | fév. | mar. | avr. | mai | jui. | jui. | aoû. | sep. | oct. | nov. | déc. | année |
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Température minimale moyenne (°C) | 5,7 | 5,8 | 5 | 4 | 2,8 | 1,8 | 2 | 1,7 | 2 | 2,3 | 3,1 | 4,6 | 3,4 |
Température moyenne (°C) | 7,1 | 7,2 | 6,5 | 5,5 | 4,4 | 3,4 | 3,5 | 3,4 | 3,7 | 4 | 4,8 | 6,1 | 4,9 |
Température maximale moyenne (°C) | 8,6 | 8,6 | 8 | 6,9 | 6 | 5 | 4,9 | 5 | 5,4 | 5,8 | 6,4 | 7,7 | 6,5 |
Précipitations (mm) | 82,2 | 86 | 96 | 92,8 | 97,2 | 83,6 | 79 | 87,6 | 68,3 | 88,8 | 72,4 | 73,6 | 1 007,7 |
Record de froid (°C) | 0,9 | 0,7 | -2 | -3 | -6,3 | -6,7 | -9,4 | -8,8 | -7 | -5 | -3,7 | -1 | -9,4 |
Record de chaleur (°C) | 12,9 | 14 | 14,3 | 14 | 10,2 | 10,8 | 11 | 10 | 10,5 | 9 | 12,4 | 13,6 | 14,3 |
Flore typique de l'île |