Megaman X conserve la formule de Megaman, dans le sens que le joueur doit toujours affronter huit bosses dans l'ordre désiré afin de progresser dans le jeu, mais y apporte néanmoins quelques nuances :
Grâce à un système d'accélération d'urgence, X peut se propulser quelques secondes afin de gagner du terrain ou éviter une attaque.
X peut grimper aux parois à l'aide de coups de pied. Cette technique est essentielle pour éviter certaines attaques et avancer dans les niveaux.
X peut augmenter sa résistance aux dégâts en récoltant des conteneurs en forme de coeur dispersés à travers les niveaux. Le jeu en compte 8 au total.
X peut améliorer ses capacités défensives et offensives en récupérant des parties d'armure développées par son créateur, le professeur Light.
Dans certains niveaux, X peut piloter une armure de combat (Ride Armor). Bien que le véhicule soit relativement lent et peu maniable, il permet à X d'infliger des dégâts considérables au corps à corps, de détruire certains éléments du décor, de charger et même de planer quelques secondes grâce à un réacteur de saut. L'armure protège également le pilote de tout dégât, mais sa résistance limitée fera en sorte qu'elle explosera après avoir encaissé de trop lourds dégâts.
L'armure que reçoit X dans Megaman X n'a pas de nom officiel. C'est pourquoi elle est souvent appelée La première armure ou encore la Light Armor (L'Armure de Light), en l'honneur de son créateur. Étant la toute première armure apparue dans la série, elle est de ce fait la moins impressionnante d'un point de vue technique, ce qui ne réduit en aucun cas son utilité au combat.
Chaque pièce de l'armure récupérée permet à X de bénéficier d'une nouvelle capacité ou encore d'en améliorer une déjà existante. Pour faciliter la compréhension du fonctionnement de l'armure, chaque pièce sera accompagnée d'une brève description de sa fonctionnalité :
À noter cependant qu'il est possible de bénéficier d'une amélioration du X-Buster sans avoir à trouver la capsule respective.
En plus des armes des Mavericks, X peut utiliser le Hadoken, technique ainsi nommée en référence à un autre jeu de Capcom, Street Fighter. Seulement, pour obtenir cette technique, il ne s'agit pas de vaincre un boss, mais plutôt de découvrir une capsule secrète, à condition bien sûr d'avoir auparavant rempli certaines conditions bien précises. Une fois cela fait, l'hologramme du professeur Light, vêtu comme Ryu, se manifestera à X et lui apprendra à se servir du Hadoken. Lorsqu'il l'utilise, X crie le nom de la technique et lance une boule de feu qui détruit d'un seul coup n'importe quel ennemi, à l'exception de la forme finale de Sigma.
Megaman X a fait l'objet d'un portage DOS, d'une réédition sur Playstation 2, Gamecube et Xbox (Megaman X Collection) ainsi que d'un remake sur Playstation Portable, Megaman Maverick Hunter X.