Sur le plan structurel, les activités techniques se concentrent sur le site de Dimona, dans le désert du Néguev. Toutefois, de cette localisation géographique, personne ne connaît véritablement le contenu des locaux qui sont soumis à un contrôle très strict et à des poursuites pénales de tout individu qui divulguerait des données relevant de la sécurité nationale.
Le site est défendu par des batteries de missiles Patriot en prévention de possibles frappes irakiennes entre 2002 et 2003.
Au début des années 2000, de nombreuses inquiétudes ont été exprimées concernant la vétusté de ce réacteur vieux de 40 ans. En 2004, par mesure de prévention, les autorités israéliennes ont fait distribuer des tablettes d'iode aux habitants des environs.
Le nucléaire militaire est un tabou qui relève plus de la doctrine stratégique que du secret technique. Seul Mordechai Vanunu a témoigné, en 1985, de ses activités ayant lieu a Dimona, le site demeurant cependant toujours secret.