Le Wildlife and Countryside Act 1981 est l'une des lois majeures de la protection de l'environnement au Royaume-Uni. Le texte interdit le déracinement et la destruction de plantes sans l'accord du propriétaire du terrain, ainsi que la cueillette de n'importe quelle partie des espèces les plus menacées, qui sont listées dans l'annexe 8. La vente de plantes sauvages, menacées ou non, est également interdite.
Le texte a été complété, en 2004, par le Nature Conservation (Scotland) Act 2004, qui améliore la protection des Sites d'intérêt scientifique particulier, renforce les sanctions pénales en cas d'atteinte à l'environnement, et confie à chaque organisme public écossais une mission de protection de la biodiversité.
La préservation de l'environnement naturel est bien développée au Royaume-Uni. Plusieurs organismes publics ont un rôle important dans la protection de la flore.
Le Scottish Natural Heritage est le corps administratif responsable de la gestion des territoires naturels en Écosse. L'une de leurs missions est d'établir des National Nature Reserves (litt. « Réserves naturelles nationales ») ; ces zones étaient au nombre de 73 en 2004, mais une révision des critères a amené de nombreux sites à perdre leur statut, abaissant le nombre de NNR à 55 en 2006.
La branche écossaise de la Forestry Commission agit sous mandat du gouvernement écossais ; il s'agit de l'un des plus grands propriétaires terriens du pays. Le Joint Nature Conservation Committee possède, lui, un rôle de conseil auprès du gouvernement sur les sujets de protection de l'environnement.
De nombreuses associations caritatives et bénévoles jouent un rôle important dans la protection de l'environnement écossais.
Le National Trust for Scotland est une organisation caritative dont le rôle est de protéger et de promouvoir l'héritage culturel et naturel écossais. Avec plus de 270 000 membres, il s'agit de la plus importante organisation de ce type en Écosse.
La Société royale pour la protection des oiseaux a pour but la conservation des oiseaux et des autres espèces d'animaux sauvages par la protection et la re-création des habitats naturels.
Le John Muir Trust est une autre organisation caritative dont l'objectif est de protéger les territoires sauvages et les espèces s'y développant, par l'achat des terres, la promotion de l'éducation et de la biologie de la conservation. Le trust possède et gère des domaines à Knoydart, Assynt, et Skye, ainsi que dans la chaîne du Ben Nevis et dans d'autres régions sauvages de l'Écosse.
Trees for Life est une organisation caritative qui cherche à restaurer une forêt sauvage dans le nord-ouest des Highlands ainsi que dans les Grampians.
L'Écosse possède deux parcs nationaux. Le Parc national des Cairngorms comprend la plus vaste région de paysage de montagnes arctiques du Royaume-Uni. Les sites recensés comme étant d'une importance particulière au sein du patrimoine naturel écossais occupent 39 % du terrain et sont d'une importance significative au niveau européen. Le Parc national des Trossachs et du Loch Lomond abrite, lui, le plus grand lac de Grande-Bretagne, ainsi que les montagnes de Breadalbane et les lochs de mer d'Argyll.
Sous l'impulsion de la Directive européenne habitats, 230 sites écossais représentant une surface de 8 748 km² ont été proposés le 31 mars 2003 au statut de zones spéciales de conservation par le gouvernement britannique.