Universités publiques
Elles sont au nombre de 82. Voici quelques unes d'entre elles :
- Université des Arts de la Préfecture d'Aichi
- Université municipale des Arts de Kyōto
- Université métropolitaine de Tōkyō
- Université de la ville de Yokohama
Universités privées
Elles sont plusieurs centaines, voici quelques unes d'entre elles :
- Université Bunkyo
- université Chūō
- Université Keiō
- Université Kitasato
- Université Meikai
- Université Meiji
- Université Tōkai
- Université Nihon
- Université Rikkyō, également connue sous le nom d'Université de Saint Paul
- Université de Seijo
- Université Sophia, dirigée par les Jésuites
- Université Tōyō
- Université Tōyō Gakuen
- Université Waseda
- université Kokushikan