Leur territoire est menacé par l'activité humaine, en particulier les mines du Liberia et les rizières de Nimba.
C'est une espèce officiellement déclarée en danger par l'Union internationale pour la conservation de la nature (IUCN) depuis 1990.
L'espèce est présente dans la Réserve naturelle intégrale du Mont Nimba en Guinée et en Côte d'Ivoire.
On sait peu de choses sur les prédateurs de cette espèce mais leur mode de vie nocturne laisse supposer qu'ils se gardent ainsi des prédateurs diurnes, à moins qu'ils ne trouvent la nuit une nourriture plus abondante.
On pense aussi que cet animal joue un rôle dans l'équilibre aquatique de par ses prélèvement sur les populations de crabes, de crustacés ou de petits poissons.
Il y a peu d'interaction avec les humains, si ce n'est leur tendance à investir les nasses des pêcheurs. Les Micropotamogale de Lamotte sont alors parfois victimes des nasses et des filets. Dans la région du Mont Nimba on a recensé en 1970 un animal noyé dans une nasse pour 10 km² et par an.