Rhizaria (classification phylogénétique) - Définition

En savoir plus

Sources bibliographiques de référence

• David Bass, Ema E.Y. Chao, Sergey Nikolaev, Akinori Yabuki, Ken-ichiro Ishida, Cédric Berney, Ursula Pakzad, Claudia Wylezich et Thomas Cavalier-Smith : « Phylogeny of Novel Naked Filose and Reticulose Cercozoa: Granofilosea cl.n. and Proteomyxidea Revised », Protist, vol. 160, 2009, pp. 75-109
• David Moreira, Sophie von der Heyden, David Bass, Purificación López-García, Ema Chao et Thomas Cavalier-Smith : « Global eukaryote phylogeny: Combined small- and large-subunit ribosomal DNA trees support monophyly of Rhizaria, Retaria and Excavata », Mol. Phylogenet. Evol., vol. 44, n°1, 2007, pp. 255-266
• Yoshiki Kunitomo, Isao Sarashina, Minoru Iijima, Kazuyoshi Endo et Katsuo Sashida : « Molecular phylogeny of acantharian and polycystine radiolarians based on ribosomal DNA sequences, and some comparisons with data from the fossil record », European journal of protistology, vol. 42, n°2, 2006, pp. 143-153
• David Bass, David Moreira, Purificación López-García, Stephane Polet, Ema E. Chao, Sophie von der Heyden, Jan Pawlowski et Thomas Cavalier-Smith : « Polyubiquitin Insertions and the Phylogeny of Cercozoa and Rhizaria », Protist, vol. 156, 2005, pp. 149-161

Autres sources bibliographiques

Sources internet

• Molecular Phylogeny of Amoeboid Protists
• Mikko's Phylogeny Archive
• The Taxonomicon
• Palaeos.org
• Palaeos.com
• Micro*scope
• NCBI Taxonomy Browser
• The Tree of Life Web Project

Liens internes

• Arbre phylogénétique
• Eukaryota (classification phylogénétique)
• Orientation bibliographique en microbiologie
• Rhizaria -- Radiolaire -- Foraminifère

Débat scientifique relatif à la phylogénie des Rhizaria

La monophylie du groupe, récemment acquise, n'est plus remise en question ; par contre, sa place au sein des Eucaryotes ne fait pas l'objet d'un consensus (il semble plus proche des Alvéolés et Straménopiles que des Excavates, rompant ainsi la monophylie des Chromalvéolés).

En son sein, l'important groupe des Cercozoaires est lui aussi de reconnaissance récente. Si certaines analyses donnent les Foraminifères comme prenant racine au sein de ce groupe, à proximité des Gromiidés et Ascétospores, d'autres les positionnent en groupe-frère des Cercozoaires, d'autres encore au sein d'un groupe de Rétariens où ils retrouvent les Radiolaires (hormis les Phéodariés qui sont des Cercozoaires) ; y sont-ils leur groupe-frère (cf. ci-dessus), ou bien les Radiolaires restreints sont-ils eux-mêmes paraphylétiques (comme les Polycystines en leur sein) ?

Classification proposée par Adl et al. 2005

Ce comité a proposé une nouvelle classification, remplaçant celle des anciens Protistes et tenant compte des phylogénies moléculaires récentes. Elle regroupe les Eucaryotes en six groupes réputés monophylétiques. Voici ce qui concerne les Rhizaria.

      ▲      └─o Rhizaria        ├─o Cercozoa        │ ├─o Cercomonadida        │ │ ├─o Cercomonadidae (peut-être paraphylétique)        │ │ └─o Heteromitidae        │ ├─o Silicofilosea        │ │ ├─o Thaumatomonadida        │ │ └─o Euglyphida        │ │   ├─o Euglyphidae        │ │   ├─o Trinematidae        │ │   ├─o Cyphoderiidae        │ │   ├─o Paulinellidae        │ │   └─? Ampullataria, Euglyphidion, Heteroglypha, Matsakision        │ ├─o Chlorarachniophyta        │ ├─o Phytomyxea        │ ├─o Phaeodarea        │ │ ├─o Phaeoconchia        │ │ ├─o Phaeocystina        │ │ ├─o Phaeogromia        │ │ └─o Phaeosphaeria        │ ├─o Nucleohelea        │ │ ├─o Clathrulinidae        │ │ └─o Gymnosphaerida        │ └─? Cryothecomonas, Gymnophrys, Lecythium, Massisteria, Metopion, Proleptomonas, Pseudodifflugia        ├─o Haplosporidia        ├─o Foraminifera        ├─o Gromia        └─o Radiolaria          ├─o Polycystinea          │ ├─o Spumellaria          │ │ ├─o Collodaria          │ │ └─o Sphaerellaria          │ └─o Nassellaria          │   ├─o Plectellaria          │   └─o Cyrtellaria          ├─o Sticholonche          └─o Acantharia            ├─o Arthracanthida            ├─o Chaunocanthida            ├─o Holocanthida            └─o Symphyacanthida