- La science et la foi, Delachaux et Niestlé, Neuchâtel, 1912
- La loi du progrès en biologie et en sociologie, Delachaux et Niestlé, Neuchâtel, 1915
- Transformons l'école, Delachaux et Niestlé, Neuchâtel, 1920
Traduit en suédois, espagnol, italien, portugais, tchèque et espéranto.
Seconde édition J. Oliven, Paris, 1947
- L'éducation dans la famille, Delachaux et Niestlé, Neuchâtel, 1921
Traduit en espagnol, roumain, allemand, grec, finlandais, turc et néerlandais
- L'autonomie des écoliers, Delachaux et Niestlé, Neuchâtel, 1921 (réimpr. 1950)
Traduit en italien, espagnol et polonais
- L'activité spontanée chez l'enfant, Delachaux et Niestlé, Neuchâtel, 1922
- L'école active, Forum, Neuchâtel ; Genève etc., 1922 (réimpr. 1953), 415 p.
Traduit en roumain, espagnol, italien, allemand, serbo-croate, japonais, portugais, anglais, ourdu et hindi
D'abord en 2 vol., puis condensé en un seul volume. 8e éd. 1972 (Delachaux et Niestlé, Neuchâtel)
Réédition 2004 (coll. « Pédagogues du monde entier », Fabert, Paris)
- Les types psychologiques chez l'enfant, chez l'adulte et au cours de l'éducation, Delachaux et Niestlé, Neuchâtel, 1922
- La pratique de l'école active, Delachaux et Niestlé, Neuchâtel, 1924 (réimpr. 1929)
Traduit en russe, portugais, italien et espagnol
- La coéducation des sexes, Delachaux et Niestlé, Neuchâtel, 1926
Repris dans Transformons l'école, 1948
- Le progrès spirituel, Delachaux et Niestlé, Neuchâtel, 1927
Traduit en espagnol, allemand et portugais
- Bakulé et son œuvre éducatrice, 1926
- Le grand coeur maternel de Pestalozzi, Delachaux et Niestlé, Neuchâtel, 1928
- L'avenir de la psychologie génétique, Delachaux et Niestlé, Neuchâtel, 1931
- L'école sur mesure, Delachaux et Niestlé, Neuchâtel, 1931
- Caractérologie typocosmique, Genève et Paris, 1932
En collaboration avec K. E. Krafft
- Nos enfants et l'avenir du pays, Delachaux et Niestlé, Neuchâtel, 1942
- Libération de l'homme, Éditions du Mont Blanc, Genève, 1943
- Vers une classification naturelle des types psychologiques, Nice, 1943
- Maison d'enfants de l'après-guerre, Delachaux et Niestlé, Neuchâtel, 1945
- L'école active à travers l'Europe, Michon, Paris, 1948
- Le Dr Frédéric Ferrière : son action à la Croix-Rouge internationale en faveur des civils victimes de la guerre, Suzerenne, Genève, 1948, 167 p.
- Brève initiation à l'éducation nouvelle, Bourrelier, Paris, 1951
- Le mystère de la personne, Rigois, Turin, 1955