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Liste partielle des publications
- Florae goettingensis specimen, sistens vegetabilia saxo calcareo propria (H. M. Grape, Göttingen, 1789).
- Annalen der Naturgeschichte (Göttingen, 1791).
- Dissertationes botanicae ; quibus accedunt Primitiae horti botanici ; et Florae rostochiensis (G. Baerensprung, Suerin, 1795).
- Philosophiae botanicae novae seu Institutionum phytographicarum prodromus (Jo. Christ. Dieterich, Göttingen, 1798).
- Voyage en Portugal, depuis 1797 jusqu'en 1799 (Levrault, Schoell et Cie, Paris, an XII-1803).
- Grundlehren der Anatomie und Physiologie der Pflanzen (Göttingen. 1807); (Principes fondamentaux de l’anatomie et de la physiologie des plantes) (il y démontre, pour la première fois, que les cellules végétales existent individuellement et ne sont pas qu’une partie d’une masse végétale homogène).
- Nachträge zu den Grundlehren etc. (Göttingen. 1809).
- Kritische Bemerkungen und Zusätze zu Karl Sprengels verk über den Bau und die Nature der Gewäsche (C. A. Rümmel, Berlin, deux volumes, 1812).
- Die Urwelt und das Altertum, erläutert durch die Naturkunde (Berlin 1820-1822, deuxième édition 1834) ; (Les Temps préhistorique et antique, expliqués par l’histoire naturelle).
- Enumeratio plantarum horti regii botanici Berolinensis altera (G. Reimer, Berlin, deux volumes, 1821-1822).
- Das Altertum und der Übergang zur neuern Zeit (Berlin 1842) ; (L’Antiquité et la transition à l’époque moderne).
- Elementa philosophiae botanicae (Berlin 1824; deuxième édition, en latin et en allemand, 1837).
- Üeber die Gattungen Melocactus und Echinocactus (Berlin, 1827).
- Hortius regius botanicus Berolinensis (G. Reimer, Berlin, deux volumes, 1827-1833).
- Anatomisch-botanische Abbildungen zur Erläuterung der Grundlehren der Kräuterkunde (Berlin, 1837-1842); (Illustrations de l’anatomie des végétaux pour l’initiation des herboristes).
- Ausgewählte anatomisch-botanische Abbildungen (Berlin, 1839-1842) (Sélection d’illustrations anatomiques végétales).
- Filicum species in horto regio Berolinensi cultae (Berlin, 1841) (Les espèces de fougères du Jardin botanique de Berlin).
- Anatomie der Pflanzen in Abbildungen (Berlin, 1843-1847) (L’anatomie des plantes illustratrée).
- Il a également publié avec Friedrich Otto :
- Icones plantarum selectarum horti regii botanici Berolinensis (Berlin, 1820-1828) (Illustrations d’une sélection de plantes du Jardin botanique du Berlin).
- Également avec Christoph Friedrich Otto et achevé par Johann Friedrich Klotzsch (1805-1860) (conservateur du Jardin botanique de 1841 à 1844).
- Icones plantarum rariorum horti regii botanici Berolinensis (Berlin 1828-31) (Illustrations de végétaux rares du Jardin botanique de Berlin).
- Il est l’auteur, avec le comte von Hoffmansegg :
- Flore portugaise (Berlin, 1809-1840) (Flore portugaise), qui est longtemps un ouvrage de référence.