Maximum de Parcimonie - Définition
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Généralités
Avantages:
- la parcimonie permet l'évaluation sur plusieurs arbres et donne des informations sur des séquences ancestrales ;
- convergence et réversions sont acceptées ;
- un état peut passer de 0 à 1 puis de 1 à 0 et ceci plusieurs fois ;
- un état peu passer de 0 à 1 sur des branches différentes.
Inconvénients:
- Le traitement avec la parcimonie est lent et coûteux si la recherche est menée sur l'intégralité des topologies possibles. Des recherches heuristiques peuvent réduire grandement le temps machine nécessaire pour fournir un arbre phylogénétique. Toutes les topologies n'auront pas été explorées, mais l'arbre (les arbres) obtenus, seront très proches de "vrai" arbre.
