- genre Abditomys Musser, 1982
- genre Acomys I. Geoffroy, 1838
- genre Aethomys Thomas, 1915
- genre Anisomys Thomas, 1904
- genre Anonymomys Musser, 1981
- genre Apodemus Kaup, 1829 — mulots
- genre Apomys Mearns, 1905
- genre Archboldomys Musser, 1982
- genre Arvicanthis Lesson, 1842
- genre Bandicota Gray, 1873
- genre Batomys Thomas, 1895
- genre Berylmys Ellerman, 1947
- genre Bullimus Mearns, 1905
- genre Bunomys Thomas, 1910
- genre Canariomys Crusafont-Pairo et Petter, 1964
- genre Carpomys Thomas, 1895 — rats des Philippines.
- genre Celaenomys Thomas, 1898 — rat-musaraigne.
- genre Chiromyscus Thomas, 1925
- genre Chiropodomys Peters, 1869
- genre Chiruromys Thomas, 1888 — rats à queue préhensile.
- genre Chrotomys Thomas, 1895 — rats des Philippines.
- genre Coccymys Menzies, 1990 — rats de Nouvelle-Guinée.
- genre Colomys Thomas et Wroughton, 1907
- genre Conilurus Ogilby, 1838
- genre Coryphomys Schaub, 1937
- genre Crateromys Thomas, 1895 — rats des nuages.
- genre Cremnomys Wroughton, 1912 — rats indiens.
- genre Crossomys Thomas, 1907 — rats de Nouvelle-Guinée.
- genre Crunomys Thomas, 1897 — rats des Philippines.
- genre Dacnomys Thomas, 1916
- genre Dasymys Peters, 1875
- genre Dephomys Thomas, 1926
- genre Desmomys Thomas, 1910
- genre Diomys Thomas, 1917
- genre Diplothrix Thomas, 1916
- genre Echiothrix Gray, 1867
- genre Eropeplus Miller et Hollister, 1921
- genre Golunda Gray, 1837
- genre Grammomys Thomas, 1915
- genre Hadromys Thomas, 1911
- genre Haeromys Thomas, 1911
- genre Hapalomys Blyth, 1859
- genre Heimyscus Misonne, 1969
- genre Hybomys Thomas, 1910
- genre Hydromys E. Geoffroy, 1804
- genre Hylomyscus Thomas, 1926
- genre Hyomys Thomas, 1904 — rats de Nouvelle-Guinée.
- genre Kadarsanomys Musser, 1981
- genre Komodomys Musser et Boeadi, 1980
- genre Lamottemys Petter, 1986
- genre Leggadina Thomas, 1910
- genre Lemniscomys Trouessart, 1881
- genre Lenomys Thomas, 1898
- genre Lenothrix Miller, 1903
- genre Leopoldamys Ellerman, 1947
- genre Leporillus Thomas, 1906
- genre Leptomys Thomas, 1897
- genre Limnomys Mearns, 1905
- genre Lophuromys Peters, 1874
| - genre Lorentzimys Jentink, 1911
- genre Macruromys Stein, 1933
- genre Malacomys Milne-Edwards, 1877
- genre Mallomys Thomas, 1898
- genre Malpaisomys Hutterer, Lopez-Martinez, et Michaux, 1988
- genre Margaretamys Musser, 1981
- genre Mastomys Thomas, 1915
- genre Maxomys Sody, 1936
- genre Mayermys Laurie et Hill, 1954
- genre Melasmothrix Miller et Hollister, 1921
- genre Melomys Thomas, 1922
- genre Mesembriomys Palmer, 1906
- genre Microhydromys Tate et Archbold, 1941
- genre Micromys Dehne, 1841
- genre Millardia Thomas, 1911
- genre Muriculus Thomas, 1903
- genre Mus Linnaeus, 1758
- genre Mylomys Thomas, 1906
- genre Myomys Thomas, 1915
- genre Neohydromys Laurie, 1952
- genre Nesokia Gray, 1842
- genre Niviventer Marshall, 1976
- genre Notomys Lesson, 1842
- genre Oenomys Thomas, 1904
- genre Palawanomys Musser et Newcomb, 1983
- genre Papagomys Sody, 1941
- genre Parahydromys Poche, 1906
- genre Paraleptomys Tate et Archbold, 1941
- genre Paruromys Ellerman, 1954
- genre Paulamys Musser, 1986
- genre Pelomys Peters, 1852
- genre Phloeomys Waterhouse, 1839
- genre Pithecheir F. G. Cuvier, 1833
- genre Pogonomelomys Ruemmler, 1936
- genre Pogonomys Milne-Edwards, 1877
- genre Praomys Thomas, 1915
- genre Pseudohydromys Ruemmler, 1934
- genre Pseudomys Gray, 1832
- genre Rattus G. Fischer, 1803
- genre Rhabdomys Thomas, 1916
- genre Rhynchomys Thomas, 1895
- genre Solomys Thomas, 1922
- genre Spelaeomys Hooijer, 1957
- genre Srilankamys Musser, 1981
- genre Stenocephalemys Frick, 1914
- genre Stenomys Thomas, 1910
- genre Stochomys Thomas, 1926
- genre Sundamys Musser et Newcomb, 1983
- genre Taeromys Sody, 1941
- genre Tarsomys Mearns, 1905
- genre Tateomys Musser, 1969
- genre Thallomys Thomas, 1920 — rats des acacias.
- genre Thamnomys Thomas, 1907
- genre Tokudaia Kuroda, 1943
- genre Tryphomys Miller, 1910
- genre Uranomys Dollman, 1909
- genre Uromys Peters, 1867 — rat géant à queue nue.
- genre Vandeleuria Gray, 1842
- genre Vernaya Anthony, 1941
- genre Xenuromys Tate et Archbold, 1941
- genre Xeromys Thomas, 1889
- genre Zelotomys Osgood, 1910
- genre Zyzomys Thomas, 1909
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