La RNase PH est une 3'-5' exoribonucléase et nucléotidyltransférase, présente chez les Archaea et les bactéries qui sert à dégrader les ARNs de transfert.
À la différence des enzymes hydrolytiques qui ont besoin d'une molécule d'eau comme cofacteur pour lar réaction, elle utilise un phosphate inorganique (phosphorylase) pour séparer dans la chaine de nucléotides, le nucléotide de l'extrêmité 3'.
La forme active de l'enzyme est une structure protéique organisée en complexe homohexamérique, composée de trois dimères de RNase PH.
La RNase PH a des homologues dans de nombreux autres organismes qui sont désignés comme RNase PH-likes. Quand une partie d'une protéine a un grand domaine très similaire à la RNase PH, on l'appelle un domaine RNase PH (RNase PH domain (RPD)).