Wikisource a mis et met progressivement en place des outils spécifiques à la nature de son projet.
L'usage d'un wiki pour l'édition de textes pose la question de la fiabilité du travail accompli par les Wikisourciens. D'une part, ce travail peut être facilement vandalisé, puisque toute personne qui a accès à Wikisource peut en modifier le contenu, d'autre part le travail d'édition lui-même doit pouvoir être vérifié pour assurer la qualité du projet.
Afin de parvenir à une garantie suffisante pour les lecteurs, Wikisource admet la semi-protection des textes relus par plusieurs contributeurs . Ainsi, seules des personnes inscrites peuvent modifier un texte validé. Les lecteurs sous IP peuvent signaler des erreurs sur une page donnée en lien dans toutes les pages de discussion des textes validés, pages de discussion où sont données également toutes les informations relatives à l'édition.
L'avancement de la validation d'un texte est signalé par les icônes suivants, placés dans l'onglet texte :
Mais l'outil permettant de réellement s'assurer de la qualité de l'édition est l'affichage des images en regard du texte édité (voir image ci-contre). Cet outil a été réalisé par un contributeur de Wikisource.
Cet outil s'utilise ainsi : après avoir copié sur le serveur l'image d'un texte, le contributeur édite un espace nommé page: suivi du nom de l'image copiée. L'image apparaît alors dans cet espace, et le contributeur la consulte tout en utilisant la boîte d'édition. L'ensemble du document peut ensuite être reconstitué en mode texte sur une seule page grâce à des inclusions.
Cet outil a été mis en place en août 2006, et son usage n'est pas encore général. Pour consulter les premiers livres disponibles en mode page : Livres disponibles en mode page.
La division par domaines linguistiques ne sépare pas entièrement les sous-projets, puisqu'il existe des liens permettant l'affichage simultanée de deux pages de deux domaines distincts. Ainsi, lorsqu'un contributeur du Wikisource francophone édite une traduction d'un texte anglais, le lien interwiki qui lie ces deux textes permet de créer automatiquement une édition bilingue.
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Un vote a eu lieu au mois d'avril 2005, sur la question de la création de sous-domaines linguistiques. Le résultat fut largement favorable à cette création. Après l'arrivée d'une nouvelle version de Mediawiki permettant un transfert des pages en conservant les historiques, les sous-domaines ont finalement été créés à la mi-août, et les pages ont été importées le 27 août 2005.
En mai 2006, alors qu'une consultation avait commencé à s'organiser parmi les contributeurs de Wikisource pour le choix d'un nouveau logo, Jimbo Wales, fondateur de Wikipédia, a décidé de le changer.
En août 2006, un contributeur de Wikisource a créé un outil d'édition permettant la correction de textes avec des images en regard. Voir plus haut dans cet article .