Le genre Australopithecus (du latin australis, « du sud », et du grec ancien πίθηκος, píthēkos, « singe ») a été défini par Raymond Dart lors de la découverte d'Australopithecus africanus en 1924.
Le nom de l'espèce, sediba, signifie « puits » ou « source » et, au sens figuré, « origine » en seSotho, une langue bantoue.
La position exacte d'Australopithecus sediba dans l'arbre généalogique des Hominini a rapidement suscité des débats.
Selon Yves Coppens, il pourrait s'agir d'un « para-Homo », fruit d'une évolution parallèle à l'ancêtre de l'Homme, descendant d'Homo erectus, lui-même descendant d'Homo habilis.