Bêta-galactosidase - Définition

Mécanisme d'action

Le site actif de la β-galactosidase catalyse l'hydrolyse de son substrat par des liaisons à la fois "en surface" et "en profondeur". Des ions K⁺ ainsi que des ions Mg⁺⁺ sont nécessaires pour obtenir une action optimale de l'enzyme. L'attache covalente au substrat se fait par le groupe carboxyle terminal de la chaîne latérale d'un acide glutamique.

Chez E. coli, on pensait que c'était l'acide aminé Glu₄₆₁ qui intervenait dans cette réaction de substitution. On sait aujourd'hui que cet acide aminé est en réalité un catalyseur acide et que c'est plutôt Glu₅₃₇ qui est l'intermédiaire covalent.

Chez l'être humain, le pôle nucléophile de l'hydrolyse est Glu₂₆₈.

Séquence

La β-galactosidase humaine contient 677 acides aminés.

              10          20          30          40          50          60      MPGFLVRILP  LLLVLLLLGP  TRGLRNATQR  MFEIDYSRDS  FLKDGQPFRY  ISGSIHYSRV                    70          80          90         100         110         120      PRFYWKDRLL  KMKMAGLNAI  QTYVPWNFHE  PWPGQYQFSE  DHDVEYFLRL  AHELGLLVIL                   130         140         150         160         170         180      RPGPYICAEW  EMGGLPAWLL  EKESILLRSS  DPDYLAAVDK  WLGVLLPKMK  PLLYQNGGPV                   190         200         210         220         230         240      ITVQVENEYG  SYFACDFDYL  RFLQKRFRHH  LGDDVVLFTT  DGAHKTFLKC  GALQGLYTTV                   250         260         270         280         290         300      DFGTGSNITD  AFLSQRKCEP  KGPLINSEFY  TGWLDHWGQP  HSTIKTEAVA  SSLYDILARG                   310         320         330         340         350         360      ASVNLYMFIG  GTNFAYWNGA  NSPYAAQPTS  YDYDAPLSEA  GDLTEKYFAL  RNIIQKFEKV                   370         380         390         400         410         420      PEGPIPPSTP  KFAYGKVTLE  KLKTVGAALD  ILCPSGPIKS  LYPLTFIQVK  QHYGFVLYRT                   430         440         450         460         470         480      TLPQDCSNPA  PLSSPLNGVH  DRAYVAVDGI  PQGVLERNNV  ITLNITGKAG  ATLDLLVENM                   490         500         510         520         530         540      GRVNYGAYIN  DFKGLVSNLT  LSSNILTDWT  IFPLDTEDAV  RSHLGGWGHR  DSGHHDEAWA                   550         560         570         580         590         600      HNSSNYTLPA  FYMGNFSIPS  GIPDLPQDTF  IQFPGWTKGQ  VWINGFNLGR  YWPARGPQLT                   610         620         630         640         650         660      LFVPQHILMT  SAPNTITVLE  LEWAPCSSDD  PELCAVTFVD  RPVIGSSVTY  DHPSKPVEKR                   670      LMPPPPQKNK  DSWLDHV