Géologiquement parlant, Culebra fait partie du groupe des Îles Vierges contrairement à Vieques qui se rattache à Porto Rico. C'est une île beaucoup plus aride que Porto Rico, et qui de plus ne possède pas de cours d'eau permanents (l'eau est importée de Vieques).
La plupart des îlots entourant Culebra, ainsi que certaines zones côtières de l'île principale, sont des réserves naturelles maritimes (pour une surface de 6 km²) principalement dédiées à la reproduction de différentes espèces de tortues de mer. La réserve ornithologique de Culebra fut créée en 1909 par le président Theodore Roosevelt, elle comprend environ 50 000 individus.