Liste partielle des publications
- 1834-1850 : Fauna Japonica.
- 1837-1844 : Abbildungen neuer oder unvollstandig bekannter Amphibien: nach der Natur oder dem Leben entworfen.
- 1854 : De zoogdieren geschetst.
- 1854-1858 : De vogels van Nederland. 3 vols.
- 1857-1858 : Handleiding tot de beoefening der dierkunde. 2 vols.
- 1860-1862 : De dieren van Nederland. Gewervelde dieren.
- 1862-1876 : Revue méthodique et critique des collections déposées dans cet établissement. 7 Vols.
- 1863-1872 : De Dierentuin van het Koninklijk Zoologisch Genootschap Natura Artis Magistra te Amsterdam zoölogisch geschetst.
- 1868 : Natuurlijke historie van Nederland. De vogels.
- 1870 : Natuurlijke Historie van Nederland. De kruipende dieren.
- 1870 : Natuurlijke Historie van Nederland. De zoogdieren.
- 1870 : Natuurlijke Historie van Nederland. De Visschen.
- 1872 : De dierentuin van het Koninklijk Zoölogisch Genootszchap Natura Artis Magistra te Amsterdam. De vogels. De zoogdieren. De kruipende dieren. Met historische herinneringen van P.H. Witkamp.
Taxons éponymes
Plusieurs espèces lui ont été dédiées :
- Otto Finsch (1839-1917) en 1876 lui dédie le Gorfou de Schlegel (Eudyptes schlegeli).
- Theodor von Heuglin (1824-1876) en 1863 le dédie le Francolin de Schlegel (Francolinus schlegelii).
- Siffleur de Schlegel – Pachycephala schlegelii.
- Tohi de Schlegel – Arremon schlegeli.
- Traquet du Karoo – Cercomela schlegelii.
- Enfin, un pétrel, décrit en 1863 (Pterodroma incerta) par Schlegel, porte en français son nom, Pétrel de Schlegel, de même que le Philépitte de Schlegel (Philepitta schlegeli) décrit en 1867, et le Siffleur de Schlegel décrit en 1871.
Et aussi :
- le Bengali de Schlegel ;
- le Boa de l'île Ronde de Schlegel, serpent vivant à proximité de l'Île Maurice ;
- le Gavial de Schlegel, crocodile de Malaisie et d'Indonésie ;
- le Merle de Schlegel, merle d'Indonésie ;
- le Philépitte de Schlegel, passereau de Madagascar ;
- le Piopio de Schlegel, passereau du nord de la Nouvelle-Zélande ;
- la Vipère de Schlegel, vipère d'Amérique centrale et du nord de l'Amérique du Sud.