Le noyer empêche la croissance de plantes qui poussent dans son voisinage : la pluie emporte avec elle un composé, le juglon, secrété par le noyer qui s'oxyde une fois au sol. Cette substance, présente dans les feuilles et l'écorce, inhibe la germination des graines et perturbe la croissance des autres plantes. Cette particularité est peut-être à l'origine de la superstition populaire qui dit que se coucher sous un noyer est dangereux.
On utilise le brou de noix comme colorant pour fabriquer des encres brunes.