Sur le plan chimique, c’est l’acide indole 3-acétique ou AIA, un acide faible qui peut facilement se dissocier.
L’auxine est synthétisée majoritairement à partir du tryptophane mais aussi à partir du chorismate à l’extrémité des tiges (dans l’apex), et dans le méristème des bourgeons terminaux.
Il y a deux voies de biosynthèse comportant chacune deux étapes.
Première possibilité :
Deuxième possibilité :
Puis l’acide indole-acétaldéhyde est transformé en acide indole-acétique (AIA, auxine) (indole-acétaldéhyde déshydrogénase)
Le chorismate est transformé en acide indole-pyruvique, puis en acide indole-acétique comme dans la voie de biosynthèse à partir du tryptophane.
L’auxine de synthèse la plus utilisée est l’acide naphtalène acétique (ANA). L’utilisation principale est le traitement local des boutures.
L’auxine a un rôle fondamental dans les biotechnologies végétales, elle permet par exemple le développement des fruits sans fécondation (comme la banane qui est un fruit parthénocarpique).