Le béryl, comme la tourmaline, est un minéral des pegmatites granitiques. De taille variable, parfois très grande, il se forme à la fin de la cristallisation des massifs granitiques, lorsque le magma restant s'est enrichi en eau (L’eau est un composé chimique ubiquitaire sur la Terre, essentiel pour tous les...) et en éléments rares par rapport au magma de départ. Les éléments minéralisateurs (fluor, bore) favorisent le développement de grands cristaux. Dans de telles pegmatites, le béryl peut être associé à la topaze, la tourmaline, la muscovite et la lépidolite, à de gros cristaux de feldspaths et de quartz, au spodumène (Le spodumène est une espèce minérale du groupe des silicates sous groupe des...) et à de nombreux oxydes de titane (Le titane est un élément chimique métallique de symbole Ti et de numéro...), tantale etc. (rutile, columbite etc.).
Le béryl peut également apparaître dans quelques syénites néphéliniques, syénites et marbres. La variété émeraude a une paragenèse métamorphique (schiste à biotite).
Les variétés transparentes sont utilisées comme pierres précieuses en joaillerie (La joaillerie est étymologiquement l'art de fabriquer des joyaux, et plus largement des objets...) et sont :
Le béryl s'altère difficilement en kaolinite, en bertrandite Be4(OH)2[Si2O7], en phénacite, en l'amphiboloïde épidydimite Na(OHBeSi3O7), en cyclosilicate milarite K2Ca4Al2Be4Si24O60·(H2O).
Le béryl ordinaire est le principal minerai de béryllium (Le béryllium est un élément chimique de symbole Be et de numéro atomique 4....).
La Nouvelle-Angleterre (La région de la Nouvelle-Angleterre (en anglais New England) est située au Nord-Est des...) (Australie) possède de nombreux gisements ; la Caroline du Nord (Le nord est un point cardinal, opposé au sud.) (États-Unis) est également une source de béryl ordinaire.
En France, le béryl a été signalé à La Villeder (Morbihan), vers Alençon (Orne), dans la Loire-Atlantique (Orvault), près de Bagnères-de-Luchon (Haute-Garonne), aux environs de Bessines (Haute-Vienne) et d'Autun (Saône-et-Loire).