Cette église comporte trois nefs d’inégale largeur et cinq travées sur une longueur de 50 mètres. La voûte est à croisée d’ogives. La grande nef se termine par un chevet plat et le chœur est de forme rectangulaire. Ses murs portent depuis 1864 des fresques du peintre seynois Ludovic Bonifay, Moïse et Elie et Les douze apôtres.
Détruits au cours de la Seconde Guerre mondiale ils comportent aujourd'hui des œuvres de facture plus moderne.
Il comporte un autel plat qui remplace depuis 1961 celui de 1864 dont il reste un bas-relief et un chœur entouré de stalles également de Bernard Sénéquier (1784-1868).
La chaire est également de Sénéquier (1829) et les statuettes et le médaillon représentant saint Augustin du sculpteur toulonnais Louis Hubac, maître-sculpteur de la Marine.
La tribune reçoit un grand orgue, datant de 1851 et installé par la maison Frédéric Junk de Toulouse (entièrement rénové en 1965).