D'après l'article 3 de son traité, AFRISTAT a exclusivement pour rôle :
Toutefois, en conformité avec le principe de subsidiarité et sous certaines conditions, le Conseil des ministres peut décider la mise en œuvre d'actions communes au niveau d'AFRISTAT.
Un fonds de capitalisation, dénommé Fonds AFRISTAT, a été créé, entre les états membres et des bailleurs avec pour objectif social de contribuer au financement de ses activités grâce aux produits financiers des placements de son capital. Ce dernier est ouvert aux états membres, aux nouveaux états africains qui adhèrent à l'institution et aux souscripteurs qui désirent apporter leur concours au développement des activités d’AFRISTAT. La gestion du Fonds est assurée par l’Agence française de développement (AFD).
Le capital initial pour la période 1998-2005 était de 3,35 milliards de FCFA : 1,85 milliards souscrits par les états membres fondateurs et 1,50 milliards par la France ; la contribution par état équivalait à 1 321 450 francs français. Le second capital, en cours de constitution, se monte à 9,18 milliards de francs CFA, dont 6,56 milliards à la charge des états membres et 2,62 milliards promis par la France. Il couvrira pour la période 2006-2015 les dépenses courantes (salaires du personnel, missions d’appui des experts dans les états, réunions des groupes d’experts, réunions statutaires, etc.).
L'ensemble des ressources se composent :
L’accord de siège entre le gouvernement de la République du Mali et AFRISTAT a été signé à Bamako, le 15 octobre 1996 par Monsieur Dioncounda Traoré, Ministre d’état, Ministre des Affaires étrangères et des maliens de l’extérieur et Monsieur Lamine Diop, Directeur général d’AFRISTAT, Le Gouvernement de la République du Mali met à la disposition d’AFRISTAT des locaux pour lui servir de bureaux situés rue 499, porte 23, Quartier Niaréla Bamako - Mali.