L'équipe se met à la recherche d'une nouvelle source d'énergie, sous la surface de l'océan. La station de forage Ancienne serait une source d'énergie inépuisable et donc vitale pour les besoins de la cité. Une fois sur place, Teyla perçoit une étrange présence. Il semblerait que l'équipe ne soit pas seule à bord de la station.
Alors que la cité est paisible et que tout le monde vaque à ses occupations, une explosion retentit, faisant de nombreux dégâts. L'origine serait une tumeur explosive et Beckett compte tout faire pour qu'il n'y ait pas d'autre victime... en négligeant sa propre sécurité.
Résumé : L'arrivée d'un nouveau vaisseau sur Atlantis est synonyme d'une frappe préventive sur les Asuran. Il s'en suit une contre-attaque de ces derniers qui met à mal les réserves d'énergies d'Atlantis.