Shan'auc, une amie très proche de Teal'c, contacte la Terre et demande de l'assistance : elle a trouvé un moyen de communiquer avec son symbiote et de le convaincre que les Goa'uld sont mauvais.
Quand la Porte des Étoiles refuse de s'ouvrir, coinçant d'autres équipes sur plusieurs autres mondes, l'équipe SG-1 enquête et apprend que les Russes ont leur propre Porte des Étoiles. Leur Porte, apparemment récupérée dans l'océan à la suite du crash du vaisseau Asgard de Thor sur Terre (durant l'épisode 1 de cette saison), reste bloquée maintenant par un vortex perpétuel qui défie toute explication.
Durant l'exploration de la planète P4X-639, l'équipe SG-1 rencontre Malikai, un explorateur humain d'un autre monde qui partage l'intérêt de Daniel pour un ordinateur extraterrestre couvert d'un étrange texte ressemblant à du latin. Comme les éruptions solaires s'intensifient sur le soleil rouge de la planète, Malikai prévient Daniel que les perturbations géomagnétiques peuvent être dangereuses pour l'équipe SG-1 et lui demande de partir, mais ce dernier refuse. Malikai l'endort alors avec une arme puis programme l'ordinateur extraterrestre. O'Neill et Teal'c accourent pour aider Daniel et sont pris, avec Malikai, dans une mystérieuse lumière bleue. Soudain, ils se retrouvent au SGC, dix heures plus tôt, se préparant à mener la mission de laquelle ils viennent juste de revenir. Et cela se passe à nouveau... et encore... et encore. Comme O'Neill se retrouve à manger le contenu du même bol de céréales encore et encore, il devient clair qu'ils ont été pris dans une boucle temporelle et que seuls Teal'c et lui conservent leurs souvenirs entre chaque cycle de dix heures. Ils doivent alors tenter de décoder le message sur la mystérieuse machine et trouver le moyen de briser la boucle temporelle.
Grâce à SG-1, une civilisation connue comme les Enkarans a été transférée d'une planète-esclave Goa'uld vers un nouveau monde sain et plus accueillant. Mais rapidement après s'être installés, les problèmes surviennent. Un de leurs villages est attaqué par un mystérieux vaisseau brûlant tout sur son passage. Les Enkarans semblent être face à une menace plus grande que les Goa'uld de leur ancienne planète.