L'île de Saint-Pierre dispose d'un nouvel aéroport, Saint-Pierre - Pointe-Blanche, mis en service en septembre 1999 et qui remplace l'ancien aéroport situé non loin de là, à la piste plus courte. La nouvelle piste de 1 800 mètres pourrait ainsi accueillir des Airbus A320 et des Boeing 737-400, avions dont l'autonomie leur permait, théoriquement, de relier directement l'archipel à la métropole. Son coût a été de 384 millions de francs (58,6 millions d'euros). La construction de ce nouvel aéroport a commencé en 1992. C'était le premier des trois volets du plan destiné à organiser un tourisme moderne dans l'archipel. Il était élaboré par le ministère central, en accord avec le Conseil général à Saint-Pierre, « et parce que la faiblesse de la desserte aérienne apparaissait comme un obstacle au développement. »
La compagnie Air Saint-Pierre est la seule compagnie régulière qui opère sur l'archipel. Basée sur l'aéroport de Saint-Pierre, elle assure ainsi, dans le cadre d'une délégation de service public, les liaisons suivantes :
Les correspondances avec la métropole sont assurées à partir de ces escales, principalement depuis Montréal.
Air Saint-Pierre assure également une desserte quotidienne (sauf le dimanche) de Miquelon dans le cadre d'une convention avec le Conseil général de l'archipel. Mais cette desserte est soumise aux aléas météo, fréquents sur l'archipel, l'aérodrome de Miquelon n'étant pas équipé d'un système d'atterrissage tous temps.
Les liaisons d'Air Saint-Pierre sont actuellement () assurées par un ATR 42 et un Cessna 10 places. Selon un rapport du Sénat, l'investissement de la nouvelle piste ne peut se justifier par la rotation de ces deux seuls avions qui pouvaient atterrir sur l'ancienne.
Le nombre total de passagers est d'environ 26 000 par an, dont près de 10 000 pour la seule liaison Saint-Pierre/Saint-Jean de Terre-Neuve. La ville de Saint-Jean (ou St John's), peuplée de 100 000 habitants, sert un peu de « centre urbain » pour les habitants de l'archipel. Il s'y rendent pour l'achat de produits de consommation, dont les prix sont beaucoup plus bas, mais également pour des raisons de santé. L'hôpital de Saint-Pierre ne pouvant couvrir tous les besoins et les spécialités, un accord a été conclu entre la Caisse de prévoyance sociale de Saint-Pierre-et-Miquelon et des hôpitaux canadiens, celui de Saint-Jean de Terre-Neuve recevant le plus de patients de l'archipel.