À l'Assistance publique - Hôpitaux de Paris, aux Hospices civils de Lyon et à l'Assistance publique - Hôpitaux de Marseille, il existe à la fois :
Avant la réforme de 2010, il existait à l'AP-HP, des comités consultatifs médicaux (CCM), rassemblant les représentants des médecins et des pharmaciens dans un hôpital.
La commission médicale d'établissement locale est informée des contrats de pôles signés au sein de l'hôpital ou du groupement d'hôpitaux (GH, Groupement hospitalier), du bilan annuel des tableaux de service et du bilan de recrutement des emplois médicaux.
Elle peut être amenée à se prononcer sur l'organisation interne de l'hôpital ou du groupement. En outre, elle rédige un rapport annuel à l'intention de la commission médicale d'établissement centrale.
Les présidents des commission médicale d'établissement locale siègent de droit à la commission centrale à la place des responsables de pôles et chefs de services dans les autres établissements publics de santé.
La CME donne son avis sur les réorganisations d'activité médicale. Elle organise le développement professionnel continu des médecins et l'évaluation de leur activité.
La CME émet obligatoirement des avis sur la plupart des points rythmant la vie hospitalière et soumis aux décisions du directeur ou aux délibérations du conseil de surveillance :
Le président de la CME élabore, avec le directeur, le projet médical, socle du projet d'établissement. Il donne son avis sur les nominations de médecins (Praticiens hospitaliers, praticiens adjoints contractuels, praticiens contractuels assistants).