Dans tous les cas, on cherchera d'abord à éliminer le ou les vers. Le traitement de choix pour toutes les infections à bothriocéphale est l'injection de gastrografine dans le duodénum. Quand l'endoscopie n'est pas disponible ou n'est pas possible, on utilisera la niclosamide (dosage : voir Taenia saginata).
En cas d'anémie bothriocéphalique, le traitement ci-dessus suffira dans les cas légers mais on pourra tout de même aider le malade par l'administration de doses modérées de vitamine B12 (par exemple 100 gammas intra-musculaires par semaine). Dans les anémies pernicieuses, la vitamine B12 sera administrée d'abord à des doses massives (1.000 gammas intra-musculaires par semaine) jusqu'au retour à la normale de l'examen hématologique puis à des doses d'entretien (de 10 à 100 gammas par semaine) pendant un temps plus ou moins long.