Plus grand archipel du monde avec près de 18 000 îles, l'Indonésie décompte officiellement 92 îles périphériques, dont 67 ont une frontière avec un pays voisin. Parmi celles-ci, 28 sont habitées.
La liste de ces 92 îles frontalières a été officialisée en 2005.
| No. | Nom | Coordonnées du point extérieur | Mer | Kabupaten | Province | Pays frontalier |
| 1. | Alor | Détroit d'Ombai | Alor | Nusa Tenggara oriental | Timor Leste | |
| 2. | Ararkula | Mer d'Arafura | Moluques du Sud-Est | Moluques | Australie | |
| 3. | Asutubun | Mer de Timor | Moluques du Sud-Est occidentales | Moluques | Timor Leste | |
| 4. | Bangkit | Mer de Célèbes | Bolaang Mongondow | Sulawesi du Nord | Philippines | |
| 5. | Barung | Océan Indien | Jember | Java Est | Australie | |
| 6. | Batarkusu | Mer de Timor | Moluques du Sud-Est occidentales | Moluques | Timor Leste | |
| 7. | Batek | Mer de Sawu | Kupang | Nusa Tenggara oriental | Timor Leste | |
| 8. | Batu Bawaikang | Mer de Célèbes | Îles Sangihe | Sulawesi du Nord | Philippines | |
| 9. | Batu Berhanti | Détroit de Singapour | Batam | Îles Riau | Singapour | |
| 10. | Batu Goyang | Mer d'Arafura | Moluques du Sud-Est | Moluques | Australie | |
| 11. | Batu Kecil | Océan Indien | Tanggamus | Lampung | Inde | |
| 12. | Batu Mandi | Détroit de Malacca | Bintan | Îles Riau | Malaisie | |
| 13. | Benggala | Océan Indien | Sabang | Aceh | Inde | |
| 14. | Bepondi | Océan Pacifique | Biak Numfor | Papouasie | Palaos | |
| 15. | Berhala | Détroit de Malacca | Deli Serdang | Sumatra du Nord | Malaisie | |
| 16. | Bras | Océan Pacifique | Biak Numfor | Papouasie | Palaos | |
| 17. | Budd | Océan Pacifique | Sorong | Papouasie occidentale | Palaos | |
| 18. | Damar | Mer de Natuna | Natuna | Îles Riau | Malaisie | |
| 19. | Dana | Océan Indien | Kupang | Nusa Tenggara oriental | Australie | |
| 20. | Dana | Océan Indien | Kupang | Nusa Tenggara oriental | Australie | |
| 21. | île de Deli | Océan Indien | Pandeglang | Banten | Australie | |
| 22. | Dolangan | Mer de Célèbes | Toli-Toli | Sulawesi central | Malaisie | |
| 23. | Enggano | Océan Indien | Bengkulu Utara | Bengkulu | Inde | |
| 24. | Enu | Mer d'Arafura | Moluques du Sud-Est | Moluques | Australie | |
| 25. | Fani | Océan Pacifique | Sorong | Papouasie occidentale | Palaos | |
| 26. | Fanildo | Océan Pacifique | Biak Numfor | Papouasie | Palaos | |
| 27. | Gosong Makasar | Mer de Célèbes | Nunukan | Kalimantan oriental | Malaisie | |
| 28. | Intata | Mer de Célèbes | Îles Talaud | Sulawesi du Nord | Philippines | |
| 29. | Iyu Kecil | Détroit de Malacca | Karimun | îles Riau | Malaisie | |
| 30. | Jiew | Mer de Halmahera | Halmahera | Moluques du Nord | Palaos | |
| 31. | Kakarutan | Océan Pacifique | Îles Talaud | Sulawesi du Nord | Philippines | |
| 32. | Karang | Mer d'Arafura | Moluques du Sud-Est | Moluques | Australie | |
| 33. | Karaweira | Mer d'Arafura | Moluques du Sud-Est | Moluques | Australie | |
| 34. | Karimun Kecil | Détroit de Malacca | Karimun | Îles Riau | Malaisie | |
| 35. | Kawalusu | Mer de Célèbes | Îles Sangihe | Sulawesi du Nord | Philippines | |
| 36. | Kawio | Mer de Mindanao | Îles Sangihe | Sulawesi du Nord | Philippines | |
| 37. | Kepala | Mer de Natuna | Natuna | Îles Riau | Malaisie | |
| 38. | Kisar | Détroit de Wetar | Moluques du Sud-Est occidentales | Moluques | Timor Leste | |
| 39. | Kolepon | Mer d'Arafura | Merauke | Papouasie | Australie | |
| 40. | Kultubai du Sud | Mer d'Arafura | Moluques du Sud-Est | Moluques | Australie | |
| 41. | Kultubai du Nord | Mer d'Arafura | Moluques du Sud-Est | Moluques | Australie | |
| 42. | Laag | Mer d'Arafura | Irian Jaya Timur | Papouasie | Australie | |
| 43. | Larat | Mer d'Arafura | Moluques du Sud-Est occidentales | Moluques | Australie | |
| 44. | Leti | Mer de Timor | Moluques du Sud-Est occidentales | Moluques | Timor Leste | |
| 45. | Liki | Océan Pacifique | Jayapura | Papouasie | Papouasie Nouvelle Guinée | |
| 46. | Lingian | Détroit de Makassar | Toli-Toli | Sulawesi Central | Malaisie | |
| 47. | Liran | Détroit de Wetar | Moluques du Sud-Est occidentales | Moluques | Timor Leste | |
| 48. | Makalehi | Mer de Célèbes | Îles Sangihe | Sulawesi du Nord | Philippines | |
| 49. | Mangkai | Mer de Natuna | Natuna | Îles Riau | Malaisie | |
| 50. | Mangudu | Océan Indien | Sumba Timur | Nusa Tenggara oriental | Australie | |
| 51. | Manterawu | Mer de Célèbes | Bolaang Mongondow | Sulawesi du Nord | Philippines | |
| 52. | Manuk | Océan Indien | Tasikmalaya | Java Ouest | Australie | |
| 53. | Marampit | Mer de Célèbes | Îles Talaud | Sulawesi du Nord | Philippines | |
| 54. | Maratua | Mer de Célèbes | Berau | Kalimantan oriental | Malaisie | |
| 55. | Marore | Mer de Célèbes | Îles Sangihe | Sulawesi du Nord | Philippines | |
| 56. | Masela | Mer de Timor | Moluques du Sud-Est occidentales | Moluques | Timor Leste | |
| 57. | Meatimiarang | Mer de Timor | Moluques du Sud-Est occidentales | Moluques | Timor Leste | |
| 58. | Mega | Océan Indien | Bengkulu Utara | Bengkulu | Inde | |
| 59. | Miangas | Mer de Célèbes | Îles Talaud | Sulawesi du Nord | Philippines | |
| 60. | Miossu | Océan Pacifique | Sorong | Papouasie occidentale | Palaos | |
| 61. | Nipa | Détroit de Singapour | Batam | Îles Riau | Singapour | |
| 62. | Nongsa | Détroit de Singapour | Batam | Îles Riau | Singapour | |
| 63. | Nusa Kambangan | Océan Indien | Cilacap | Java central | Australie | |
| 64. | Panambulai | Mer d'Arafura | Moluques du Sud-Est | Moluques | Australie | |
| 65. | Panehan | Océan Indien | Trenggalek | Java Est | Australie | |
| 66. | Pelampong | Détroit de Singapour | Batam | Îles Riau | Singapour | |
| 67. | Raya | Océan Indien | Aceh Barat | Aceh | Inde | |
| 68. | Rondo | Océan Indien | Sabang | Aceh | Inde | |
| 69. | Rusa | Océan Indien | Aceh Besar | Aceh | Inde | |
| 70. | Salando | Mer de Célèbes | Toli-Toli | Sulawesi Central | Malaisie | |
| 71. | Salaut Besar | Océan Indien | Aceh Utara | Aceh | Inde | |
| 72. | Sambit | Mer de Célèbes | Berau | Kalimantan oriental | Malaisie | |
| 73. | Sebatik | Détroit de Makassar | Nunukan | Kalimantan oriental | Malaisie | |
| 74. | Sebetul | Mer de Chine méridionale | Natuna | Îles Riau | Vietnam | |
| 75. | Sekatung | Mer de Chine méridionale | Natuna | Îles Riau | Vietnam | |
| 76. | Sekel | Océan Indien | Trenggalek | Java Est | Australie | |
| 77. | Selaru | Mer de Timor | Moluques du Sud-Est occidentales | Moluques | Australie | |
| 78. | Semiun | Mer de Natuna | Natuna | Îles Riau | Malaisie | |
| 79. | Sentut | Détroit de Singapour | Bintan | Îles Riau | Malaisie | |
| 80. | Senua | Mer de Chine méridionale | Natuna | Îles Riau | Malaisie | |
| 81. | Sibarubaru | Océan Indien | Îles Mentawai | Sumatra Ouest | Inde | |
| 82. | Simeuleuceut | Océan Indien | Aceh Barat | Aceh | Inde | |
| 83. | Simuk | Océan Indien | Nias | Sumatra du Nord | Inde | |
| 84. | Sinyaunyau | Océan Indien | Îles Mentawai | Sumatra Ouest | Inde | |
| 85. | Sophia Louisa | Océan Indien | Lombok Barat | Nusa Tenggara occidental | Australie | |
| 86. | Subi Kecil | Mer de Natuna | Natuna | Îles Riau | Malaisie | |
| 87. | Tokong Belayar | Mer de Natuna | Natuna | Îles Riau | Malaisie | |
| 88. | Tokong Malang Biru | Mer de Natuna | Natuna | les Riau | Malaisie | |
| 89. | Tokong Nanas | Mer de Natuna | Natuna | Îles Riau | Malaisie | |
| 90. | Tokongboro | Mer de Natuna | Natuna | les Riau | Malaisie | |
| 91. | Wetar | Mer de Banda | Moluques du Sud-Est occidentales | Moluques | Timor Leste | |
| 92. | Wunga | Océan Indien | Nias | Sumatra du Nord | Inde |