Les découvertes préhistoriques effectuées dans les environs de la ville témoignent déjà de la présence humaine dans le néolithique, III millénaires avant J.C. Quand les Romains sont arrivés sur ces terres, ils ont témoigné qu'en ces dernières habitaient les Caristios (Caristes). Les Romains ont intégré la vallée de Deba dans le conventus de Clunia, structure politique qui a été maintenue jusqu'aux wisigoths.
Pendant un certain temps, cette partie de la vallée de Deba a appartenu au royaume de Pampelune Nájera (celui qui sera plus tard le royaume de Navarre) comme une partie de celui duranguesado. Quand la zone s'est transformée en limite entre Gipuzkoa et le Seigneurie de Biscaye a été appelée, des deux côtés de la ligne de division, Markina. Dans la vallée de Deba étaient définie la Marquina de Yuso et la Marquina de Suso laquelle était étendue par la vallée de la rivière Ego. Dans des terres de Marquina de Suso se situe l'ancienne église de San Andres qui avait un concept monastique.
Les premières informations sur Eibar datent de 1193 et ils font référence à la maison des seigneurs d'Unzueta en rapport dans leur lutte aux côtés des oñacin. En 1267 on fait référence à la cession du patronat de la paroisse aux seigneurs d'Olaso de la localité voisine d'Elgóibar par le roi Alfonse X dit le Sage.
Le 5 février 1346 le roi Alfonso XI de Castille donne des privilèges de ville à l'ancienne église de San Andres. La nouvelle ville reçoit le nom de Villanueva de San Andres de Heybar.
Les familles féodales qui dominaient le territoire de la ville ont pris part à la guerre des bandes. Eibar, comme le reste des populations de la vallée, maintenait une industrie du fer basée sur les forges et sur la fabrication d'armes.
En 1766 Eibar prend part dans les Matxinada et des années plus tard, en 1749, subit l'attaque des français qui détruisent la ville.
Au XIXè siècle des processus d'industrialisation se produisent avec la transformation du système corporatif de production dans un système industriel. Avec ce processus l'importants mouvements sociaux se produisent. Dans les Guerres Carlistes, les eibaraiss avaient été décantés déjà par le côté libéral, mais à la fin du XIXè siècle et dans la première moitié du XXè siècle, les idées du mouvement ouvrier international et socialistes arrivent dans la société eibaraise. le 6 août 1897, vit sa première grève et peu après le mouvement ouvrier obtiendra qu'Éibar soit dans un socialisme espagnol. Ceci terminerait le 14 avril 1931 avec la proclamation de la seconde république espagnole et Eibar sera la première ville espagnole a en profiter. Ceci lui a valu l'octroi du titre de Ville la plus exemplaire.
Le chemin de fer arrive à Éibar en 1887 quand on inaugurera la gare haute de Malzaga, dans celui qui sera un important croisement de lignes. Quelques années plus tard, en 1909 on inaugurerait la gare de chemin de fer d'Eibar.
La Guerre Civile fait qu'Eibar est déclarée région dévastée en étant pratiquement détruite dans son intégralité, la reconstruction a fait place à l'important développement industriel et l'a une augmentation de la population qui est arrivée durant quelques années à dépasser les 40.000 habitants, s'étendant même aux populations voisines.
Le développement industriel et urbain a été effectué dans une orographie compliquée, la vallée de l'Ego est très étroite, qui oblige un urbanisme et une architecture, tant industrielle comme résidentielle, caractéristique. Le développement vertical des bâtiments avec le mélange entre industrie et résidence à la fois d'un accès compliqué à quelques urbanisations (question qui a été minorée avec l'utilisation de moyens mécaniques comme escaliers et élévateurs).
La difficulté d'extension des installations industrielles fait que commence un processus d'émigration à d'autres lieux de beaucoup d'entreprises. À ce fait on a ajouté la grave crise industrielle qui a commencé en 1973 et affecté l'infrastructure industrielle eibaraise.
Au début du XXIè siècle, en ayant perdu presque la moitié de sa population commence une repopulation lente affirmée dans l'industrie et dans les services.