Rhodophyta (classification phylogénétique) - Définition

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- Introduction - Arbre phylogénétique - En savoir plus - Débat scientifique relatif à la phylogénie des Rhodophyta

En savoir plus

Notes et références

(en) Freshwater, D. Wilson (2000) Florideophyceae. Version 24 March 2000 http://tolweb.org/Florideophyceae/21781/2000.03.24 in The Tree of Life Web Project
(en) Saunders, Gary W., Hommersand, Max H. (2004) Assessing red algal supraordinal diversity and taxonomy in the context of contemporary systematic data. Am. J. Bot. 91: 1494-1507
(en) Yoon, Hwan Su, Müller, Kirsten M., Sheath, Robert G., Ott, Franklyn D., Bhattacharya, Debashish (2006) Defining the major lineages of red algae (Rhodophyta). J. Phycol. 42: 482-492
(en) Moreira, David, Le Guyader, Hervé, Philippe, Hervé (2000) The origin of red algae and the evolution of chloroplasts. Nature 405: 69-72
(en) Van de Peer, Yves, De Wachter, Ruppert (1997) Evolutionary relationships among the eucaryotic crown taxa taking into account site-to-site rate variation in 18S rRNA. J Mol Evol 45: 619-630
(en) Nozaki, Hisayoshi, Matsuzaki, Motomichi, Takahara, Manabu, Misumi, Osami, Kuroiwa, Haruko, Hasegawa, Masami, Shin-i, Tadasu, Kohara, Yuji, Naotake, Ogasawara, Kuroiwa, Tsuneyoshi (2003) The phylogenetic position of Red Algae revealed by multiple nuclear genes from mitochondria-containing eukaryotes and an alternative hypothesis on the origin of plastids J Mol Evol 56: 485-497
(en) Yoon, Hwan Su, Hackett, Jeremiah D., Pinto, Gabriele et Bhattacharya, Debashish (2002) The single, ancient origin of chromist plastids, PNAS 99 (24): 15507-15512
(en)Yoon, Hwan Su, Hackett, Jeremiah D., Ciniglia, Claudia, Pinto, Gabriele, Bhattacharya, Debashish (2004) A Molecular Timeline for the Origin of Photosynthetic Eukaryotes, Mol. Biol. Evol. 21(5):809-818

Autres sources bibliographiques

Cabioc'h, J., Floc'h, J.-Y., Le Toquin, A., Boudouresque, C.F., 2006. Guide des algues des mers d'Europe, Delachaux et Niestlé (éd.). ISBN 260301384X.

Sources internet

Algaebase.org
Catalogue of the Benthic Marine Algae of the Indian Ocean

Liens internes

Arbre phylogénétique
Eukaryota (classification phylogénétique)
- Archaeplastida (classification phylogénétique)
Photo-guide taxinomique de la faune et de la flore sous-marine
Photo-guide taxinomique du monde végétal
Orientation bibliographique en botanique, phycologie et mycologie (taxinomie)
Rhodophyta

Débat scientifique relatif à la phylogénie des Rhodophyta

Éclatement des anciennes Bangiophycées

Au fil des analyses moléculaires, l'ancien taxon des Bangiophycées, qui comprenait toutes les Rhodophytes autres que les Floridéophycées, a montré son caractère totalement paraphylétique. La position relative, à la base des Rhodophytines sensu Yoon, des clades des Compsopogonophycées, des Porphyridiales, des Stylonématales, voire des Rhodellales, n'est pas encore claire.

En passant en revue les données phylogénétiques publiées auparavant, Saunders et Hommersand (2004) proposent de redéfinir les relations entre les taxons, en se concentrant sur les taxons de niveaux supérieurs à l'ordre.

      └─o sous-règne Rhodoplantae        ├─o embranchement Cyanidiophyta        │ └─o classe Cyanidiophyceae        └─o embranchement Rhodophyta          ├─o sous-embranchement Rhodellophytina (vraisemblablement paraphylétique)          │ └─o classe Rhodellophyceae          │   ├─o ordre "Porphyridiales 1" (Rhodella)          │   ├─o ordre Stylonematales          │   │ └─o famille Stylonemataceae          │   └─o ordre Porphyridiales          ├─o sous-embranchement Metarhodophytina          │ └─o classe Compsopogonophyceae          │   ├─o ordre Compsopogonales          │   │ ├─o famille Boldiaceae          │   │ └─o famille Compsopogonaceae          │   └─o          │     ├─o ordre Erythropeltidales          │     │ └─o famille Erythrotrichiaceae          │     └─o ordre Rhodochaetales          │       └─o famille Rhodochaetaceae          └─o sous-embranchement Eurhodophytina            ├─o classe Bangiophyceae            │ └─o ordre Bangiales            └─o classe Florideophyceae              ├─o sous-classe Hildenbrandiophycidae              │ └─o ordre Hildenbrandiales              └─o                ├─o sous-classe Nemaliophycidae                │ ├─o ordre Acrochaetiales                │ ├─o ordre Balbianiales                │ ├─o ordre Balliales                │ ├─o ordre Batrachospermales                │ │ ├─o famille Batrachospermaceae                │ │ ├─o famille Lemaneaceae                │ │ └─o famille Psilosiphonaceae                │ ├─o ordre Colaconematales                │ ├─o ordre Corallinales                │ │ ├─o famille Corallinaceae                │ │ └─o famille Sporolithaceae                │ ├─o ordre Nemaliales                │ │ ├─o famille Galaxauraceae                │ │ └─o famille Liagoraceae                │ ├─o ordre Palmariales                │ │ ├─o famille Palmariaceae                │ │ ├─o famille Rhodophysemataceae                │ │ └─o famille Rhodothamniellaceae                │ ├─o ordre Rhodogorgonales                │ └─o ordre Thoreales                └─o                  ├─o sous-classe Ahnfeltiophycidae                  │ ├─o ordre Ahnfeltiales                  │ └─o ordre Pihiellales                  └─o sous-classe Rhodymeniophycidae                    ├─o ordre Bonnemaisoniales                    │ ├─o famille Bonnemaisoniaceae                    │ └─o famille Naccariaceae                    ├─o ordre Ceramiales                    │ ├─o famille Ceramiaceae                    │ ├─o famille Dasyaceae                    │ ├─o famille Delesseriaceae                    │ └─o famille Rhodomelaceae                    ├─o ordre Gelidiales                    ├─o ordre Gigartinales                    │ ├─o famille Acrosymphytaceae                    │ ├─o famille Acrotylaceae                    │ ├─o famille Areschougiaceae                    │ ├─o famille Blinksiaceae                    │ ├─o famille Calosiphoniaceae                    │ ├─o famille Caulacanthaceae                    │ ├─o famille Corynocystaceae                    │ ├─o famille Cruoriaceae                    │ ├─o famille Cubiculosporaceae                    │ ├─o famille Cystocloniaceae                    │ ├─o famille Dicranemataceae                    │ ├─o famille Dumontiaceae                    │ ├─o famille Endocladiaceae                    │ ├─o famille Furcellariaceae                    │ ├─o famille Gainiaceae                    │ ├─o famille Gigartinaceae                    │ ├─o famille Gloiosiphoniaceae                    │ ├─o famille Haemeschariaceae                    │ ├─o famille Kallymeniaceae                    │ ├─o famille Mychodeaceae                    │ ├─o famille Mychodeophyllaceae                    │ ├─o famille Nizymeniaceae                    │ ├─o famille Petrocelidaceae                    │ ├─o famille Peyssonneliaceae                    │ ├─o famille Phacelocarpaceae                    │ ├─o famille Phyllophoraceae                    │ ├─o famille Polyideaceae                    │ ├─o famille Rhizophyllidaceae                    │ ├─o famille Rissoellaceae                    │ ├─o famille Schmitziellaceae                    │ ├─o famille Solieriaceae                    │ ├─o famille Sphaerococcaceae                    │ └─o famille Tichocarpaceae                    ├─o ordre Gracilariales                    │ ├─o famille Gracilariaceae                    │ └─o famille Pterocladiophilaceae                    ├─o ordre Halymeniales                    │ ├─o famille Halymeniaceae                    │ ├─o famille Sebdeniaceae                    │ └─o famille Tsengiaceae                    ├─o ordre Nematostomatales                    │ ├─o famille Nematostomataceae                    │ └─o famille Schizymeniaceae                    ├─o ordre Plocamiales                    │ ├─o famille Plocamiaceae                    │ ├─o famille Pseudoanemoniaceae                    │ └─o famille Sarcodiaceae                    └─o ordre Rhodymeniales                      ├─o famille Champiaceae                      ├─o famille Faucheaceae                      ├─o famille Lomentariaceae                      └─o famille Rhodymeniaceae

Les termes de Rhodoplantae ou de Rhodobiota (Rhodobiontes) proposés assez récemment par certains auteurs sont discutés. La dernière phylogénie en date propose de ne retenir que le terme de Rhodophyta (Rhodophytes) pour l'embranchement, avec deux sous-embranchements : Cyanidiophytina et Rhodophytina (Yoon et al., 2006).

Ce travail est basé sur l'analyse des séquences de deux gènes chloroplastiques (psaA et rbcL) dans 48 espèces et de 7 autres séquences (psaB, psbA, psbC, psbD, tufA, 18SrADN et 16SrADN) dans un nombre de taxons plus restreint.

      └─o règne Eukaryota        └—o embranchement Rhodophyta Wettstein 1901           ├─o sous-embranchement Cyanidiophytina H.S. Yoon, K.M. Müller, R.G. Sheath, F.D. Ott et D. Bhattacharya 2006           │ └-o classe Cyanidiophyceae Merola, Castaldo, De Luca, Gambardella, Musacchio et Taddei 1981           │   └———o ordre Cyanidiales Christensen 1962           │       ├—o famille Cyanidiaceae Geitler 1935           │       └—o famille Galdieriaceae Merola, Castaldo, De Luca, Gambardella, Musacchio et Taddei 1981           │          └—o sous-embranchement Rhodophytina            ├-o classe Bangiophyceae Wetstein 1901             │ └———o ordre Bangiales Nägeli 1847             │     └—o famille Bangiaceae Engler 1892             │            ├-o classe Compsopogonophyceae G.W. Saunders et Hommersand 2004             │ ├———o ordre Compsopogonales Skuja 1939             │ │   ├—o famille Boldiaceae Herndon 1964             │ │   └—o famille Compsogonaceae Schmitz in Engler et Prantl 1896             │ │            │ ├———o ordre Erythropeltidales Garbary, Hansen et Scagel 1980             │ │   └—o famille Erythrotrychiaceae G.M. Smith 1933             │ │            │ └———o ordre Rhodochaetales Bessey 1907             │     └—o famille Rhodochaetaceae Schmitz in Engler et Prantl 1896             │            ├-o classe Florideophyceae Cronquist 1960 (non détaillée dans l'article)            │            ├—o classe Porphyridiophyceae H.S. Yoon, K.M. Müller, R.G. Sheath, F.D. Ott et D. Bhattacharya 2006             │ └—──o ordre Porphyridiales Kylin ex Skuja 1939             │     └—o famille Porphyridiaceae Skuja 1939             │            ├—o classe Rhodellophyceae Cavalier-Smith 1998             │ └───o ordre Rhodellales H.S. Yoon, K.M. Müller, R.G. Sheath, F.D. Ott et D. Bhattacharya 2006             │     └—o famille Rhodellaceae H.S. Yoon, K.M. Müller, R.G. Sheath, F.D. Ott et D. Bhattacharya 2006             │            └—o classe Stylonematophyceae H.S. Yoon, K.M. Müller, R.G. Sheath, F.D. Ott et D. Bhattacharya 2006               └───o ordre Stylonematales Drew 1956                   └—o famille Stylonemataceae Drew 1956

Position des Rhodophyta dans l'arbre des Eucaryotes

Deux hypothèses différentes existent.

Selon, entre autres, Moreira et al. (2000), les Rhodophyta (qu'ils nomment Rhodobionta) sont le taxon-frère des Chlorobionta et ces deux groupes forment les Metabionta.

Selon Van de Peer & De Wachter (1997), Nozaki et al. (2003, 2005), Yoon et al. (2002 et 2004), les Rhodophyta ne sont pas le groupe-frère des plantes vertes, et seraient à la base d'un vaste taxon comprenant des groupes précédemment rattachés aux protistes ainsi que les Straménopiles.