En 1701, on construit un nouveau cloître ; en 1773, c’est un nouveau palais monastique qui voit le jour. La communauté est alors la plus riche de la province, même si la piété n’est plus de mise à Cherlieu.
En 1789, les 30 villages qui dépendent de Cherlieu viennent réclamer les titres de redevances seigneuriales. Les moines doivent signer, mains liées, corde au cou sous le glaive, sur la place de Montigny, la renonciation à leurs droits. Les archives brûlent.
Toute l’abbaye est vendue le 14 juin 1791, durant 11 jours ; le cloître est démoli ; l’église, démontée, sert de carrière pendant plus d’une trentaine d’années, et se dégrade au cours des décennies ; les tombes, dont celle d’Othon IV, alors restaurée, sont mises en pièces.
Ne subsistent aujourd’hui que des restes du cloître du XVe siècle et des bâtiments conventuels des XVIIe et XVIIIe siècles, transformés en ferme, ainsi que le logement du portier ; de l’église, seul est encore debout un mur du transept. À la ferme du Ferry, un calvaire du XVIIe siècle témoigne encore de l’histoire religieuse des lieux. À Marlay, on voit encore des éléments de la tuilerie et du four à chaux ; les bâtiments datent du XVIe siècle. À Agneaucourt des témoins du broyage du minerai de fer extrait à Noroy subsistent.
Assoncourt et Exencourt (vers Gourgeon ?), Forlesmont et Etramont (vers Baulay ? ), Gondelencourt (Port-d’Atelier ? ), Olencourt (vers Semmadon ? ), Maboncourt (Aboncourt ? ), Noncourt, Chaumont (vers Pisseloup), Andricourt (vers Gourgeon), les Courcelles (vers Cornot)
Marlay, Agneaucourt, Montigny, Romain et Fontain (versPreigney), Velotte (vers Montigny), Grange-Neuve (vers le moulin du Battant), Les Craies (Jussey),
Les Charmes (entre Semmadon et Arbecey), Villers (Malvillers),
Bichecourt (entre Betoncourt-sur-Mance et Vernois-sur-Mance), Gircourt (entre Vitrey-sur-Mance et Rosières),
Corcelottes (vers Cornot), Courcelles (vers Cornot), les Minières (entre Gourgeon et Nervezain), Purgerot, Gondelencourt (Port d’Atelier ? ),
Miévillers (vers Cendrecourt), Trémoncourt (vers Venisey), Saponcourt, Betaucourt, Gommoncourt (vers Saponcourt), Grande-Vigne (vers Purgerot), Magny-lès-Jussey
Moulins de l’Etang (vers Betaucourt), des Poupières (vers Betaucourt ? ), Belin (vers Cendrecourt), de Boccey (vers Miévillers), d’Effondray (entre Fouchécourt et Port d’Atelier), Bosliébrant (Purgerot),
Moulins de Betoncourt-sur-Mance, Bichecourt, Molinssoules (à Jussey),
Moulins de Conflans-sur-Lanterne, Briaucourt,
Moulins de Gourgeon, les Courcelles (vers Cornot), Vauconcourt,
Moulins de Villers, de la Rochotte (près des Courcelles),
Moulins de Montigny, Agneaucourt, La Perrière (vers Bougey),
Moulins du Battant, du Ferry,
Moulin de Magny-lès-Jussey,
Montigny, Preigney, Lavigney, Cendrecourt, Betaucourt, Briaucourt
Pêcheries aux Poupières (entre Betaucourt et Cendrecourt), à Jussey, à Miévillers, à Warengecourt (vers Fouchécourt ?), à Gondelencourt, à Purgerot, à Bichecourt, à Conflans-sur-Lanterne,