Chronologie de la botanique - Définition

XVIIIe siècle

• 1705 : mort de John Ray, fondateur de la botanique moderne.
• 1718 : le Jardin du roi devient un véritable établissement d'étude des végétaux et plus seulement des espèces à valeurs médicales.
• 1727 : Stephen Hales publie le résultat de ses recherches sur la respiration des plantes.
• 1753 : Carl von Linné publie Species plantarum, point du départ du système du binôme linnéen et de la nomenclature botanique.
• 1762 : parution du premier ouvrage français employant le système du binôme linnéen, Hortus regius monspeliensis d'Antoine Gouan (1733-1821), suivi en 1765 de la première flore régionale, Flora Monspeliaca.
• 1763 : Michel Adanson fait paraître ses Familles des Plantes qui propose une nouvelle méthode de la classification des plantes.
• 1779 : Jan Ingenhousz découvre le rôle de la lumière dans la photosynthèse.
• 1787 : Thomas Walter fait paraître la première flore de l'Amérique du Nord utilisant le système linnéen.
• À partir des années 1790, Erik Acharius, botaniste suédois, fait paraître des travaux sur la taxinomie des lichens et est considéré comme le fondateur de la lichenologie.

XVIIe siècle

• 1601 : parution de Rariorum plantarum historia de Charles de l'Écluse (1525-1629) qui regroupe ses ouvrages précédents. Sa classification n'est pas très évoluée mais ses descriptions sont excellentes.
• 1605 : Claude Duret (v. 1570-1611) fait paraître Histoire admirable des plantes et herbes esmerveillables et miraculeuses en nature... (Paris, 1605) où il décrit des plantes étranges pour un arbre dont les feuilles s'enfuient sur de petites pattes lorsqu'elles touchent terre.
• 1635 : publication de l'Édit royal créant le Jardin du roi à Paris. Il est officiellement inauguré en 1640. Il a pour vocation, comme son nom l'indique, Jardin royal des plantes médicinales, de cultiver uniquement des plantes médicinales.
• 1640 : parution de Theatrum botanicum de John Parkinson.
• 1670 : publication de la première flore de Grande-Bretagne : Catalogus plantarum Angliæ et insularum adjacentium de John Ray.
• 1671 : Marcello Malpighi fait paraître une étude sur l'anatomie végétale marquant le début de cette discipline.
• 1686 : Début de la parution de Historia plantarum generalis de John Ray, première tentative d'une flore du globe. Il y présente une définition de l'espèce très proche de celle utilisée par Carl von Linné plus tard.
• 1694 : Rudolf Jakob Camerarius fait paraître De Sexu Plantarum Epistola où il démontre le rôle des étamines et du pistil dans la reproduction végétale.

Botanique du XXe siècle, XXIe siècle et du futur

De nouvelles stratégies de travail et de formation sont permises par l'interaction entre de nouveaux outils tels que :

• SIG et outils de cartographie automatique (à partir d'imagerie satellitale, aérienne, au sol, etc.  ;
• outils d'analyse taxinomique ;
• outils d'analyse biochimiques et génétiques (Puces à ADN, etc.) ;
• moteurs de recherche, d'indexation, de navigation de plus en plus « intelligent »s ;
• logiciels d'aide au travail collaboratif (wikis notamment)  ;
• licences libres ou collaboratives de type creative commons...

Le croisement entre ces outils grâce à des procédures et logiciels dits d'interopérabilité, ouvre un large et nouveau champ à une botanique parfois dite « botanique numérique » alors que les botanistes universitaires ont été au XXème siècle de moins en moins nombreux à être formés, mais de plus en plus sollicités pour répondre aux enjeux, urgences et incertitudes liés à la fonte accélérée de la biodiversité et aux dérèglements climatiques.

Les technologies de communication sans fil (dont la téléphonie portable), associées au GPS et à d'autres matériels informatiques fixes et "nomades" devraient en effet rapidement permettre l'identification botanique assistée par ordinateur, y compris sur le terrain, grâce notamment à des logiciels experts améliorant des moteurs de recherche par « identification visuelle ». Inversement, les identifications de terrains devraient pouvoir enrichir les bases de données générales.

Des expériences comme Telabotanica ont déjà montré l'intérêt d'associer des réseaux d'amateurs et des communautés de spécialistes, ainsi que d'améliorer l'accès aux données. Il existe en France un projet de plateforme botanique collaborative « Pl@ntNet ».

La botanique "numérique" pourrait ainsi contribuer à :

• mieux lutter (là où il faut et quand il faut, voire de manière automatique et robotisée) contre les adventices des cultures.
• améliorer la Bioévaluation (évaluation de la patrimonialité écologique en particulier, importante pour les études d'impacts et délivrances de dérogation en échange d'une compensation forte et efficace). ;
• améliorer le suivi de l'état sanitaire et physiologique des espèces et de leurs populations. Quelques outils de détection automatique existent déjà (par exemple pour pulvériser des pesticides uniquement vers les plantes indésirables pour l'agriculteur ou pour cueillir des fruits dans les branches). Peut-être un jour des robots arracheront-ils les mauvaises herbes, sans user de produits chimiques.
• suivre les espèces introduites et/ou invasives :
• suivre la chorologie (répartition des populations végétales), et les impacts des changements climatiques ;
• détecter la toxicité de plantes ;
• et plus généralement contribuer à un monitoring plus proche du "temps réel" de la biodiversité ;
• amélioration de la modélisation appliquée au règne végétal. Les simulations d'évolution d'un paysage sont une des applications possibles (La simulation de l'architecture des végétaux a pu évoluer vers la prédiction de l'évolution des peuplements).
• meilleur accès aux données via des portails internet plus conviviaux et ergonomiques pour les non-spécialistes, comme pour les experts.

De nouvelles clés d'identification dichotomiques, graphiques, visuelles, et textuelles simplifiées de détermination, gestion des bases de données numériques ou numérisées de photos de flores, de banques de graines flores anciennes numérisées et corrigées et mises à jour, ainsi que des logiciels simulant l'évolution de la flore selon les conditions du milieu, ou permettant d'évaluer la bioconcentration ou la circulation de certains polluants dans la chaine alimentaire, etc. sont quelques exemples de ce que devrait permettre la botanique dans un futur proche.

Les ordinateurs et banques de données mises en réseau ainsi qu'un travail plus collaboratif devraient doper la recherche, mais aussi permettre l'accès de la botanique à un plus grand nombre d'amateurs et au grand public. Une des conditions pour ceci est d'améliorer l'interopérabilité des bases de données et logiciels (objectif qui est en France coordonné par le réseau SINP qui peut s'appuyer sur de nouvelles bases de données nomenclaturales, et des projets en cours de développement tels que baseflor, baseveg, CATMINAT, ainsi que les bases de données phytosociologiques de Tela-botanica.

Ces améliorations devraient aussi avoir des répercussions dans le droit de l'environnement où il faudra de plus en plus mettre à jour les listes d'espèces protégées et menacées, la botanique évoluant, ce qui implique de devoir référencer différemment des espèces renommées ou sous-divisées ou regroupées en nouveaux taxons. La botanique numérique devrait aussi améliorer la formation des scientifiques, le travail des bureaux d'étude et la lutte contre le trafic de bois ou d'espèces végétales menacées ou protégées (par les douanes et la gendarmerie par exemple, dans le cadre de la CITES). Des outils « multi-entrée », s'appuyant par exemple sur des « typologies par portraits-robot » et un choix filtré par les potentialités du site concerné et référencé.