De nombreuses espèces d'oiseaux marins trouvent refuge à Fatu Huku, dont un grand nombre de frégates qui nichent dans les bosquets de pisonias. On trouve aussi la gallicolombe des Marquises, espèce endémique probablement répandue autrefois sur tout l'archipel, mais qui à cause de l'introduction de chats dans les principales îles ne se trouve plus aujourd'hui qu'à Fatu Huku, et en un peu plus grand nombre à Hatutu. Selon l'archéologue R. Linton, cet oiseau était sacré pour les anciens Marquisiens.