Reptiles
Tortues
- Pelomedusidae
- Pelusios seychellensis - Endémique des Seychelles, éteinte
- Testudinidae
- Cylindraspis borbonica - Réunion
- Cylindraspis indica - Réunion.
- Cylindraspis inepta - Maurice, éteinte au début du XVIIIe siècle
- Cylindraspis peltastes - Rodriguez, éteinte en 1800
- Geochelone nigra galapagoensis - Ile Charles (Galapagos)
Lézards
- Gekkonidae
- Phelsuma gigas - Endémique de Rodriguez, éteint à la fin du XIXe siècle
- Iguanidae
- Leiocephalus eremitus - Endémique de l'île Navassa, éteint en 1900.
- Leiocephalus herminieri - Endémique de la Martinique, éteint dans les années 1830
- Teiidae
- Ameiva cineracea - Endémique de la Guadeloupe, éteint au début du XXe siècle
- Ameiva géant de la Martinique (Ameiva major) - Endémique de la Martinique, éteint
- Anguidae
- Scincidae
- Leiolopisma mauritiana - Endémique de l'île Maurice, éteint en 1600.
- Macroscincus coctei - Endémique des îles du Cap Vert, éteint au début du XXe siècle
- Tachygia microlepis - Endémique de Tongatapu aux Tonga, éteint ?
- Tetradactylus eastwoodae - Endémique d'Afrique du sud, éteint.
- Tiliqua adelaidensis - Endémique d'Australie, éteint en 1959
Serpents
- Boidae
- Bolyeria multocarinata - Endémique de l'île Ronde (Maurice), éteint en 1975
- Typhlopidae
- Colubridae
- Alsophis ater
- Alsophis sancticruris
- Liophis cursor - Couresse de la Martinique, considérée comme éteinte depuis 1963 sur l'île principale (redécouverte sur le Rocher du Diamant par la suite)
- Liophis perfuscus - Couresse de la Barbade, éteint au XXe siècle
- Atractaspididae
- Aparallactus nigriceps - Serpent endémique du Mozambique, éteint
Oiseaux
Voir liste des espèces d'oiseaux disparues
Poissons
- Petromyzontidae
- Lampetra minima - Lamproie endémique des États-Unis, éteinte en 1953
- Catostomidae
- Chasmistes liorus liorus - Sous-espèce nominale, endémique des États-Unis, éteinte.
- Chasmistes muriei - États-Unis
- Lagochila lacera - États-Unis, éteint en 1910.
- Cottidae
- Cottus echinatus - États-Unis, éteint en 1928
- Cyprinidae
- Evarra bustamantei - Mexique
- Evarra eigenmanni - Mexique
- Evarra tlahuacensis - Mexique
- Gila crassicaudata - États-Unis
- Cyprinodontidae
- Fundulus albolineatus - États-Unis, éteint en 1900.
- Goodeidae
- Empetrichthys merriami - États-Unis, éteint en 1953.
- Poeciliidae
- Gambusia georgei - États-Unis, éteint en 1953.
- Retropinnidae
- Prototroctes oxyrhynchus - Endémique de Nouvelle-Zélande, éteint dans les années 1920.
- Salmonidae
- Coregonus alpenae - Grands Lacs (Canada, États-Unis), éteint en 1978.
- Coregonus confusus - Endémique du lac de Morat (Suisse). Éteint entre 1885 et 1950.
- Coregonus johannae - Grands Lacs (Canada, États-Unis), éteint en 1955.
- Truite argentée (Salvelinus agassizi) - États-Unis), éteinte en 1930.
- Trichomycteridae
- Rhizosomichthys totae - Silure endémique du lac Tota, en Colombie, éteint