Le Christianisme a toujours joué un rôle clé dans la construction et l'entretien des hôpitaux, comme il l'a fait dans la plupart des autres régions de l'Empire. De nombreux hôpitaux ont été construits et mis en place par les évêques dans leurs diocèses respectifs. Les hôpitaux sont presque toujours construits à proximité ou autour des Eglises et l’accent a été mis sur l'idée de guérison par le biais du salut - Quand la médecine échouait, les médecins demandaient à leurs patients de prier. Lorsque les problèmes posés par les iconoclastes ont été résolus, les saints qui étaient généralement invoqués étaient Saint Cosmes et Saint Damien qui ont été mis à mort par Dioclétien en 303 et qui sont les saints patrons de la médecine et des médecins.
Le christianisme a également joué un rôle clé dans la propagation de l'idée de charité, la médecine est devenue, selon Gary Ferngren, accessible à tous et ... facile. Cette idée, ainsi que les moyens importants dont disposaient les médecins byzantins ont été la traduction du fait que, pour la première fois dans l'histoire, l'Etat s’est véritablement investi dans l’organisation d’un système public de soins de santé.
Une contribution importante de Byzance est sans doute le fait qu'il a été le premier Empire à posséder des établissements médicaux - généralement mis en place par l’Église ou l'État, qui ont prospéré de la même manière que les hôpitaux modernes. Bien qu’il existât des établissements similaires dans la Grèce et la Rome antique, ils étaient différents dans la mesure où il s’agissait généralement soit d’institutions destinées à un usage militaire, soit de lieux où les citoyens venaient mourir en paix. Les établissements médicaux de ce type étaient fréquents dans les villes impériales comme Constantinople et plus tard Thessalonique.
Le premier hôpital a été construit par Basile de Césarée à la fin du quatrième siècle, et bien que ces institutions aient prospéré, c'est seulement à partir du 8e et 9e siècles qu'ils ont commencé à apparaître dans les villes de province (bien que les subventions de Justinien aux médecins du secteur privé pour travailler dans le secteur public six mois par an puisse être considéré comme le point de départ d’une véritable percée). La médecine byzantine était basée entièrement sur des centres hospitaliers ou des dispensaires pour les soins ambulatoires faisant partie d’un complexe hospitalier et il y existait une hiérarchie avec un médecin-chef (archiatroi), des infirmières professionnelles (hypourgoi) et des aides soignants (hyperetai).
Les médecins eux-mêmes étaient bien formés et très probablement diplômés de l'Université de Constantinople puisque la médecine était devenue une véritable discipline universitaire pendant la période Byzantine (malgré l'importance des grands médecins de l'Antiquité, son statut de science a été grandement amélioré par son intégration dans les structures d’enseignement (en particulier à l'Université de Constantinople). Cette rigidité à travers le professionnalisme (similaire au professionnalisme existant dans la fonction publique byzantine) présente de nombreuses similitudes avec les hôpitaux modernes d'aujourd'hui, et ces comparaisons sont presque toujours faites par les chercheurs actuels étudiant ce domaine particulier. Ainsi, nous savons qu’au douzième siècle, Constantinople possédait deux hôpitaux biens organisés et encadrés par des médecins spécialistes (comprenant des femmes médecins), avec des salles distinctes pour différents types de Maladies et des méthodes de traitement formalisées.