Maskelyne est dépeint très négativement dans le livre de Dava Sobel. Une longue querelle l'opposa en effet à l'horloger John Harrison sur le problème de la détermination précise de la longitude posé par le longitude Act. Tandis qu'Harrison fournit bien une méthode et un instrument plus précis que ce que proposait Maskelyne, l'utilisation de la distance lunaire est meilleur marché et restera préférée pour le calcul des longitudes en mer durant le siècle suivant. Les observations et calculs de Maskelyne étant basés sur le méridien de Greenwich qui sera proposé et adopté comme méridien de référence en 1884.
Entre autres honneurs il reçoit la médaille Copley en 1755.