Il a également collaboré au Journal du Progrès des sciences médicales.
Il était encore médecin à la Salpêtrière lors du siège de Paris en 1870 et pendant la Commune. Membre (octobre 1870) de l'Assistance publique, élu en juillet 1871 au conseil municipal de Paris pour le quartier du Panthéon (1871-74), où il représente les libéraux-républicains (centre-droit) qui soutiennent le gouvernement Thiers, et plusieurs fois président du conseil comme doyen d'âge, il quitta la vie active en 1875 et passa désormais l'hiver dans le Midi, où il mourut en 1879.
Il avait été nommé chevalier de la Légion d'honneur le 18 juillet 1849.
Un de ses fils, Émile Trélat (1821-1907), fut le fondateur de l'École spéciale d'architecture (ESA), et un autre, Ulysse Trélat (1828-1890), fut un célèbre chirurgien.