Fly540 : Nairobi, Masai Mara, Malindi, Lamu, Zanzibar avec extension vers Dar es Salam et la région du mont Kilimanjaro (aéroport international du Kilimandjaro) ;
Jetairfly : Bruxelles, Zanzibar ;
Kenya Airways : Nairobi ;
Martinair Holland : Amsterdam ;
Monarch Airlines (uniquement en charter) : Londres (aéroport de Gatwick), Manchester ;
My Travel (Thomas Cook Airlines) ;
Neos : Vérone, Milan, Rome, Bologne ;
Precision Air : région du mont Kilimanjaro, Zanzibar ;
24 avril 1986, un Shorts SC.7 Skyvan 3M-100 des forces de polices du Malawi (Malawi Police Force), en phase d'approche, et en panne de carburant, effectue un atterrissage forcé et percute un arbre, à 18 km de l'aéroport, blessant légèrement le pilote et son passager ;
En octobre 2009, un Boeing cargo 707-321C percute les balises lumineuses de l'aéroport et brise son train d'atterrissage droit sans faire de victime.