Kliper est un projet de future navette spatiale russe, initialement prévue pour remplacer les Soyouz. Après le retrait des navettes spatiales des États-Unis en 2010, les vaisseaux russes Kliper et Soyouz seront les seuls à emporter des humains vers la Station spatiale internationale (ISS), jusqu'à l'arrivée du Orion (CEV) des États-Unis.
Les sources divergent, il a d'abord été annoncé lors du salon Farnborough en 2006 que Roskosmos a annoncé l'annulation du programme. Cependant, selon d'autres sources, l'avenir du programme n'est pas encore défini, le Groupe de constructions spatiales RKK Energia présentant à l'Agence spatiale russe Roskosmos un projet remanié du vaisseau spatial récupérable Kliper avant fin 2007.
L'agence spatiale russe RosaviaKosmos a commencé à travailler sur le projet Kliper depuis 2000 et se base sur des recherches antérieures de véhicule de transport spatial datant des années 1990. Il est prévu pour remplacer le Soyouz, qui existe en différentes versions depuis 1967.
Une maquette grandeur nature a été présentée au Salon international aérospatial de Moscou (MAKS) 2005 par son constructeur, RKK Energia.
En février 2004, le projet Kliper fut inclus dans le programme spatial russe pour les années 2005-2015, en forte hausse (budget augmenté de 26 % en 2005, puis de 6 % par an ensuite). Le premier lancement est annoncé pour 2012 et la phase opérationnelle après 2015.
La maquette du Kliper était en tournée en 2005 en Europe et en Asie, afin de trouver des partenaires intéressés par une participation au financement ou par un co-développement de la navette. L'agence russe est particulièrement demandeuse d'une collaboration avec l'Agence spatiale européenne (ESA), qui est devenue son principal partenaire depuis quelques années. Au Salon du Bourget, l'ESA avait d'ailleurs annoncé son intérêt pour le projet, lequel n'a cependant pas été retenu lors de la dernière réunion au niveau ministériel.
L'agence russe rechercha néanmoins toujours d'autres coopérations ou financements, notamment auprès du Japon, et a fait savoir qu'elle accepterait toutes propositions, excepté de la NASA, qui porte un projet concurrent, le CEV. La Russie avait annoncé son intention de développer seule Kliper si aucun partenaire n'est trouvé.
Le budget estimé par l'agence russe en 2004 était de 10 milliards de roubles, soit environ 280 millions d'euros. Cette estimation paraît largement optimiste, le Guardian, se basant sur les coûts de programmes similaires, avance un chiffre qui lui paraît plus juste de 3 milliards de dollars pour la conception et la construction du Kliper jusqu'en 2015, dont 1,8 milliard venant de l'Europe. Dw-world.de avance lui la somme d'un milliard et demi d'euros.
Le budget spatial russe voté pour les années 2006 à 2015 est de 305 milliards de roubles (soit un peu plus de 8 milliards d'euros).
La conception du Kliper tente de résoudre les problèmes connus de tout engin spatial.
Le Soyouz est un module orbital sphérique, utilisé comme cuisine et sanitaires, au-dessus du module de retour. Il est équipé d'un sas en dessous du dispositif d'amarrage. Il a été conçu pour pouvoir quitter une station spatiale en urgence, sur une trajectoire courbe, ou droite en temps normal.
Le Kliper a le module orbital au-dessous du module de retour, et le dispositif d'amarrage est situé en dessous. Ceci est possible grâce à la largeur supérieure du module de retour, qui permet d'adapter des becs de fusée qui servent à l'amarrage. Aucun vaisseau des États-Unis n'a jamais possédé un équipement comparable, excepté le module d'amarrage Apollo-Soyouz.
En liaison avec cette nouvelle conception, le Kliper possédera un système de secours en cours de lancement, ce qui permettra de séparer le module de la fusée en cas de problème. Ce décrochage sera possible à chaque phase du lancement, excepté pendant les premières secondes du décollage.