Le Boeing 747-400 est, en 2009, le seul Boeing 747 en production et était le plus gros avion commercial en service avant l’introduction de l’Airbus A380. La série -400 est la plus vendue et la plus aboutie de la famille 747. L’appareil devrait être supplanté par le Boeing 747-8.
Annoncé en octobre 1985, l’avion vole pour la première fois le 29 avril 1988. La certification est reçue le 10 janvier 1989 avec les moteurs PW4000, le 18 mai 1989 avec des CF6-80C2s et le 8 juin 1989 avec des RB211-524Gs. Le premier 747-400 est livré à la Northwest Airlines le 26 janvier 1989 et entre en service le 9 février 1989.
Comparé au 747-300, le 747-400 a des ailes allongées de 2 m et équipées de winglets. le cockpit est également équipé d’un réservoir de queue et d’instruments électroniques (glass cockpit) supprimant ainsi le poste d’ingénieur de vol. Les moteurs ainsi que le fuselage et les ailes sont améliorés et de nouveaux divertissements proposés à bord de l’appareil.
Alors que l’envergure a été augmentée, le poids total des ailes a diminué grâce à l’utilisation de matériaux composites et d’alliages d’aluminium.
Le 747-400F (Freighter) est un appareil entièrement dédié au fret qui utilise le fuselage du 747-200F. Le premier vol a lieu le 4 mai 1993 et l’avion est entré en service chez Cargolux Airlines le 17 novembre 1993. Parmi les compagnies clientes on compte Atlas Air, Cargolux, China Airlines, Korean Air, Nippon Cargo Airlines, Polar Air Cargo, et Singapore Airlines.
La United States Air Force a acheté sept 747-400Fs pour installer un laser embarqué (Boeing YAL-1). L’appareil a été grandement modifié afin de supporter une tourelle montée sur le nez et un laser chimique oxygène-iode (COIL : Chemical Oxygen Iodine Laser).
Le 747-400M a la possibilité de basculer de transport de passager à fret. Il vole pour la première fois le 30 juin 1989 et entre en service chez KLM le 12 septembre 1989. Le -400M possède une grande porte cargo à l’arrière du fuselage.
Le 747-400D (D pour domestique)possède une grande densité de sièges et est principalement destiné aux vols nationaux sur le marché japonais. Avant la venue de l’A380, c’était l’avion avec la plus grande capacité de passagers au monde. Le -400D ne possède pas d’extension de bout d’aile et de winglets, réduisant ainsi les contraintes sur les ailes lors des nombreux décollages/atterrissages. Le -400D peut être facilement converti vers la version longue distance au besoin. Les deux seules compagnies utilisatrices sont JAL et ANA.
Le premier vol a lieu le 18 mars 1991 et l’appareil prend son service chez Japan Airlines le 22 octobre 1991.
Le 747-400ER (ER pour Extended range ou autonomie étendue) est lancé le 28 novembre 2000 à la suite d’une commande de Qantas pour 6 appareils. Le -400ER peut parcourir 805 km supplémentaires et emporter 6 800 kg de fret en plus. Qantas reçoit le premier -400ER le 31 octobre 2002. Ce modèle présente une décoration intérieure proche de celle du 777, connue sous le nom de Boeing Signature Interior (signature intérieure de Boeing).
Le 747-400ERF est la version fret du -400ER, lancée le 30 avril 2001. Le -400ERF est livré à Air France (via ILFC) le 17 octobre 2002.
Le 747-400BCF (Boeing Converted Freighter) est la conversion du 747-400 passagers en version tout cargo. Le projet est lancé en 2004. Cathay Pacific reçoit son 1er exemplaire converti en décembre 2005.
Le 747-400LCF (Large Cargo Freighter) est une version modifiée du 747-400 que Boeing utilise depuis 2007 pour transporter les éléments de fuselage du 787 Dreamliner et d’autres éléments structurels depuis les sites de production en Italie et au Japon vers l’usine d’assemblage à Seattle aux États-Unis. Il est comparable au Beluga d’Airbus et au Super Guppy d’Aero Spacelines, Inc. 2 appareils ont été construits.