Le soin apporté à l'aspect des produits dérivés de l'univers des X-Files est une remarquable constante. On retiendra, par exemple, la boîte du jeu vidéo datant de 1998 ou les coffrets des DVD, proposant des effets de transparence ou des reflets moirés.
Entre chaque diffusion américaine et française des saisons The X-Files, une compilation d'épisodes mythologiques ont été édité par 20th Fox Home Entertainment sous la forme de dossiers ou longs-métrages vidéo (VHS et DVD). Par ailleurs, The X-Files: Combattre le Futur est disponible dans ces formats.
En plus des coffrets individuel The X-Files (un coffret par saison), des coffrets Intégrale (un coffret avec toute la série), la série existe également sous la forme d'une collection kiosque aux éditions Atlas. Cette collection est constituée d'un DVD avec quelques épisodes et un fascicule.
20th Century Fox Home Entertainment édita à partir de décembre 2008 en Blu-ray, une version director's cut du second film, The X-Files: Régénération qui exploita la technologie BD-Live, ainsi qu'une réédition du premier film The X-Files: Combattre le Futur.
Bande originale, musique de film
La musique de la série et des films est signée Mark Snow. Plusieurs CD sont sortis :
1996 : Songs in the Key of X (compilation de chansons et musiques d'artistes divers inspirés ou tirés de la série)
1996 : The Truth and the Light: Music From the X-Files - Music by Mark Snow, Word by Chris Carter (musiques et dialogues tirés des trois premières saisons).
1998 : The X-Files: Fight the Future - Original Motion Picture Score by Mark Snow (bande originale du premier film)
1998 : The X-Files: The Album - Fight the Future (compilation de chansons et musiques d'artistes divers inspirés ou tirés du premier film)
25 juillet 2008 :The X-Files : I want to believe - Original Motion Picture Score by Mark Snow (bande originale du film X-files : Régénération - titre original : I want to believe)
Romans, novélisation
Des épisodes des premières saisons ont été adaptés en romans (en France aux Éditions J'ai lu) par Ls. Martin, Ellen Steiber, Easton Royce, Garth Nix et Eric Elfman.
Des romans reprenant l'univers mais avec une intrigue originale.
The X Files (09/1997). Fabricant Sega Pinball Inc., É.-U. (Chicago). Créateurs Rob Hurtado et Morgan Weistling
Jeux vidéo
1998 : The X-Files Game
2004 : X-Files Resist or serve
Films
Frank Spotnitz, scénariste des films The X-Files
1998 : The X-Files: Combattre le Futur (The X-Files : Fight The Future) de Rob Bowman (script de Chris Carter et Frank Spotnitz) avec David Duchovny, Gillian Anderson. Ce film concerne particulièrement la mystérieuse huile noire. Au niveau chronologique, l'histoire prend place entre la saison 5 et la saison 6 de la série télévisée.
2008 : The X-Files: Régénération (The X-Files: I Want to Believe) de Chris Carter (script de Chris Carter et Frank Spotnitz) Sortie dans les salles aux États-Unis le 25 juillet 2008. Sortie en Belgique, en France et en Suisse romande le 30 juillet 2008. Plus de cinq ans après la fin de la série TV et malgré le passé, le FBI prend contact avec Mulder et Scully afin de résoudre une affaire non classée concernant un agent. Ce film traite davantage de la relation complexe entre le couple qu'un retour aux sources.