En 2002, il existe plus de 41 800 km de voies navigables aux États-Unis. Le fleuve Mississippi et les Grands Lacs sont les deux voies majeures du pays pour le transport des marchandises. Le Mississippi a fait l'objet de nombreux aménagements et aujourd'hui, environ la moitié du Missouri-Mississippi est navigable. Des bateaux de 2,70 mètres de tirant d’eau y ont accès et peuvent remonter jusqu’à Minneapolis. Chaque année, 290 000 000 tonnes de marchandises passent par treize ports situés au nord de La Nouvelle-Orléans sur le Mississippi. Le fleuve est également relié par des canaux aux Grands Lacs de Saint Louis à Chicago, à l'Illinois, à la Floride et au Texas par la Gulf Intracoastal Waterway. La Voie maritime du Saint-Laurent, qui est administrée conjointement par le Canada et les États-Unis, rend l'accès aux Grands Lacs possible depuis l'océan Atlantique. Dans les Grands Lacs, le transport est assuré par des vraquiers spécifiques, les vraquiers des Grands Lacs. Le plus connu d'entre eux est le SS Edmund Fitzgerald, qui sombra dans les eaux du lac Supérieur en 1975 au cours d'une tempête. Les bateaux doivent être de taille Seawaymax pour emprunter les écluses et assurer la jonction des lacs à l'océan. Le canal Érié établit une autre voie fluviale entre l'océan Atlantique et les Grands Lacs en reliant l'Hudson au Lac Érié, mais il est surtout utilisé par les navires de plaisance.
Les États-Unis possèdent le plus grand réseau d'oléoducs et de gazoducs du monde, respectivement longs de 300 000 et 550 000 kilomètres.