La mise en service des BB 25500 a permis de gommer les effets négatifs des diverses frontières électriques entre le 1,5 kV continu et le 25 kV 50 Hz : en région parisienne, notamment à l'Ouest et à l'Est de la ligne de Grande Ceinture, dans le Sud-Est (notamment autour de Dijon, Lyon et Marseille), puis dans l'Ouest (électrification de la Bretagne). Tous les types des trains sont concernés (voyageurs, notamment régionaux et Transilien, marchandises).
À la répartition par activités le 1er janvier 1999, les BB 25500 sont réparties entre Fret, TER et Transilien.
En 2006, la radiation de la série est commencée, notamment pour les machines fret, du fait de leur âge et de la concurrence des nouvelles BB 27000 notamment. L'activité de la série se concentre sur :
Depuis le changement d'horaire du 10 décembre 2006, des BB 25500 (dont la BB 25553) tractant deux rames inox omnibus (RIO) roulent en service international Franco - Suisse grâce à la desserte transfrontalière Genève - La Plaine - Bellegarde. En décembre 2008, ce service a été renforcé pour passer de deux à quatre rames RIO avec une BB 25500 supplémentaire. Ce sont des agents de conduite de l'entreprise CFF SA qui assurent ces prestations, formés par l'entreprise Login.
De plus, une locomotive de ce type est louée par CFF Cargo pour la desserte marchandises de l'antenne entre Genève La Praille et Vernier-Meyrin (- La Plaine) (1,5 kV courant continu). La conduite est assurée par du personnel suisse de CFF Cargo, formé par l'entreprise Login.
Le parc fret de BB 25500 a été dissous à cette même date.
Depuis l'application du service hiver 2009/2010, les BB 25500 sont mise en service sur le TER Nord-Pas-de-Calais. Elles remplacent les BB 16500 sur cette région. Les dernières BB 16500 sont désormais toutes employés sur TER Picardie
(liste non exhaustive)
La BB 25626 (livrée béton) en pousse d'une RIO sur un TER Albertville - Chambéry à l'approche de son terminus | La BB 25664 (livrée béton) en tête d'une rame Corail sur un TER Chambéry - Albertville | La BB 25610 quitte la gare Montparnasse |
Cette locomotive a été reproduite en HO par la firme Lima et la BB 25531 par Jouef.
PIKO annonce la sortie de six versions différentes par leurs livrées, à l'échelle N, pour le 4e trimestre 2010.