La lutte contre la flavescence dorée, en raison des graves conséquences sur le vignoble et de la présence dans de nombreux départements français de la cicadelle vectrice, est réglementée par deux arrêtés ministériels :
Chaque année, les modalités de lutte ainsi que le périmètre de lutte obligatoire sont fixés par département après arrêté préfectoral. Le périmètre de lutte obligatoire concerne les communes qui ont été reconnues contaminées par le SRPV, après confirmation de la présence du phytoplasme, ainsi que les communes limitrophes. Il est donc obligatoire de déclarer le plus tôt possible, les parcelles susceptibles d'être contaminées aux SRPV, qui, après prélèvement et analyse confirment la présence ou non du phytoplasme.
Les modalités de la lutte obligatoire sont :
Les moyens de lutte contre la cicadelle vectrice sont particulièrement limités en agriculture biologique. Seules deux spécialités à base de roténone sont homologuées. L'emploi de tout autre insecticide fait perdre la certification "agriculture biologique", même dans le cas où la parcelle concernée se trouve dans un périmètre défini de lutte obligatoire.
La maladie de la flavescence dorée est une maladie de quarantaine qui fait l'objet d'une lutte obligatoire depuis 1987. Il n'existe pas de méthodes de lutte directe contre l'agent responsable à savoir le phytoplasme. La lutte, essentiellement chimique, est donc dirigée contre le vecteur de la maladie Scaphoideus titanus.
Les méthodes culturales de prévention sont également indispensables pour limiter l'extension de la maladie.
Des vignes abandonnées et donc dépourvues de lutte contre la Flavescence dorée et son vecteur, peuvent constituer un réservoir de pouvoir infectieux pour les vignobles voisins. Il est indispensable de les arracher et de les brûler.
De même, pour éviter l'apparition et l'extension de foyers isolés, il est indispensable de repérer rapidement les pieds atteints pour ensuite les arracher et les brûler.
Enfin, une dernière pratique consiste à brûler les bois de taille de plus de deux ans porteurs d'oeufs de cicadelles.