Introduction
En biochimie, les oxydo-réductases sont des enzymes catalysant les réactions d'oxydo-réduction en transférant les ions H+ et des électrons.
Elles sont associées à des coenzymes d'oxydoréduction (NAD, FAD, FMN...).
Plusieurs de ces enzymes sont connues en tant que :
- oxydases,
- réductases,
- peroxydases,
- oxygénases,
- hydrogénases, ou
- déshydrogénases.
Réactions
Une enzyme catalysant une réaction du type :
- A– + B → A + B–
est par exemple une oxydoréductase. Dans cet exemple, A est le réducteur (donneur d'électron) et B l'oxydant (accepteur d'électron).
Dans les réactions biochimiques, les réactions rédox sont parfois plus difficile à identifier en tant que telles, comme par exemple la réaction de glycolyse:
- Pi + glycéraldéhyde-3-phosphate + NAD+ → NADH + H+ + 1,3-bisphosphoglycérate
Dans cette réaction, NAD+ est l'oxydant et le glycéraldéhyde-3-phosphate le réducteur.
Classification
Les oxydoréductases sont classées EC 1 dans la nomenclature EC des enzymes. Les oxydoréductases peuvent être ensuite divisées en 22 sous-catégories :
- EC 1.1 qui regroupe les oxydoréductases qui agissent sur les groupes donneurs CH-OH (alcool oxydoréductase)
- EC 1.2 qui regroupe les oxydoréductases qui agissent sur les groupes donneurs aldéhyde ou cétone
- EC 1.3 qui regroupe les oxydoréductases qui agissent sur les groupes donneurs CH-CH (CH-CH oxydoréductases)
- EC 1.4 qui regroupe les oxydoréductases qui agissent sur les groupes donneurs CH-NH2 (acide aminé oxydoréductases, monoamine oxydase)
- EC 1.5 qui regroupe les oxydoréductases qui agissent sur les groupes donneurs CH-NH
- EC 1.6 qui regroupe les oxydoréductases qui agissent sur le NADH ou le NADPH
- EC 1.7 qui regroupe les oxydoréductases qui agissent sur les autres groupes donneurs contenant de l'azote
- EC 1.8 qui regroupe les oxydoréductases qui agissent sur les autres groupes donneurs contenant du soufre
- EC 1.9 qui regroupe les oxydoréductases qui agissent sur les autres groupes donneurs de type hème
- EC 1.10 qui regroupe les oxydoréductases qui agissent sur les diphénols et composés proches donneurs
- EC 1.11 qui regroupe les oxydoréductases qui agissent sur les peroxydes comme accepteurs (peroxydases)
- EC 1.12 qui regroupe les oxydoréductases qui agissent sur l'hydrogène comme donneur (hydrogénase)
- EC 1.13 qui regroupe les oxydoréductases qui agissent sur les donneurs seuls avec incorporation de molécule de dioxygène (monoxygénases)
- EC 1.14 qui regroupe les oxydoréductases qui agissent sur les donneurs appariés avec incorporation de molécule de dioxygène (dioxygénases)
- EC 1.15 qui regroupe les oxydoréductases qui agissent sur les radicaux superoxydes accepteurs
- EC 1.16 qui regroupe les oxydoréductases qui oxydent les ions métalliques
- EC 1.17 qui regroupe les oxydoréductases qui agissent sur les groupes CH ou CH2
- EC 1.18 qui regroupe les oxydoréductases qui agissent sur les protéines fer-soufre donneuses
- EC 1.19 qui regroupe les oxydoréductases qui agissent sur la flavodoxine réduite donneuse
- EC 1.20 qui regroupe les oxydoréductases qui agissent sur les donneurs phosphore ou arsenic
- EC 1.21 qui regroupe les oxydoréductases qui agissent sur les groupes X-H et Y-H pour former une liaison X-Y
- EC 1.97 qui regroupe les autres oxydoréductases
Enzymes |
Types | EC 1 Oxydo-réductases : EC 1.1 - EC 1.2 - EC 1.3 - EC 1.4 - EC 1.5 - EC 1.6 - EC 1.7 - EC 1.8 - EC 1.9 - EC 1.10 - EC 1.11 - EC 1.12 - EC 1.13 - EC 1.14 - EC 1.15 - EC 1.16 - EC 1.17 - EC 1.18 - EC 1.19 - EC 1.20 - EC 1.21 - EC 1.97 - EC 1.98 - EC 1.99 EC 2 Transférases : EC 2.1 - EC 2.2 - EC 2.3 - EC 2.4 - EC 2.5 - EC 2.6 - EC 2.7 - EC 2.8 - EC 2.9 EC 3 Hydrolases : EC 3.1 - EC 3.2 - EC 3.3 - EC 3.4 - EC 3.5 - EC 3.6 - EC 3.7 - EC 3.8 - EC 3.9 - EC 3.10 - EC 3.11 - EC 3.12 - EC 3.13 EC 4 Lyases : EC 4.1 - EC 4.2 - EC 4.3 - EC 4.4 - EC 4.5 - EC 4.6 - EC 4.99 EC 5 Isomérases : EC 5.1 - EC 5.2 - EC 5.3 - EC 5.4 - EC 5.5 - EC 5.99 EC 6 Ligases : EC 6.1 - EC 6.2 - EC 6.3 - EC 6.4 - EC 6.5 - EC 6.6 |
Thèmes | Allostérie - Catalyse enzymatique - Cinétique enzymatique - Coenzyme - Cofacteur - Constante de Michaelis - Coopérativité - Enzyme parfaite - Équation de Michaelis-Menten - Inhibiteur - Nomenclature EC - Représentation de Lineweaver-Burk - Site actif - Site de liaison - Liste d'enzymes |