Virus à ARN - Définition

Groupe III - Virus à ARN à double brin (dsRNA)

• Famille des Birnaviridae
• Famille des Chrysoviridae
• Famille des Cystoviridae
• Famille des Hypoviridae
• Famille des Partitiviridae
• Famille des Reoviridae – incluant les Rotavirus
• Famille des Totiviridae
• Genres non assignés
  • Endornavirus

Réplication

Les virus à ARN chez les animaux sont classés en trois groupes distincts en fonction de leur génome et de leur mode de réplication (de leur groupe dans l'ancienne classification de Baltimore):

• Les Virus à ARN double brin (Groupe III) contiennent une douzaine de molécules d'ARN différentes, chacune codant pour une ou plusieurs protéines virales.
• Les Virus à ARN à simple brin à polarité positive (Groupe IV) utilisent directement leur génome comme s'il s'agissait d'un ARNm, produisant une protéine unique, qui est modifiée par l'hôte et des protéines virales qui forment les diverses protéines nécessaires à la réplication. L’une d’elles est la polymérase ARN-dépendante, qui copie l'ARN viral pour former une matrice réplicative à double brin, qui à son tour permet d’entraîner la formation de nouveaux virions.
• Les Virus à ARN à simple brin à polarité négative (Groupe V) dont le génome doit être copié par une ARN polymérase pour former un ARN à polarité positive. Cela signifie que le virus doit emporter avec lui l’enzyme polymérase ARN dépendante. La molécule d'ARN de sens positif agit alors comme un ARNm viral qui est traduit en protéines par les ribosomes de l'hôte. La protéine qui en résulte continue à commander la synthèse de nouveaux virions, ainsi que les protéines de la capside et l'ARN réplicase, qui est utilisée pour produire de nouvelles molécules d’ARN de sens négatif.

• Les Rétrovirus (groupe VI) ont un génome d’ARN à simple brin, mais ne sont généralement pas considérés comme des virus à ARN, car ils utilisent des ADN intermédiaires pour se répliquer. La transcriptase inverse, une enzyme virale qui provient du virus lui-même après qu’il ait perdu sa membrane, convertit l'ARN viral en un brin d'ADN complémentaire, qui est copié pour produire une molécule d'ADN viral double brin. Ensuite cet ADN est intégré, l'expression des gènes codés peut entraîner la formation de nouveaux virions.

Groupe V – Virus à ARN simple brin à polarité négative (ssRNA)

• Ordre des Mononegavirales
  • Famille des Bornaviridae - Bornaviridae
  • Famille des Filoviridae - incluant le virus Ebola, le virus Marburg
  • Famille des Paramyxoviridae – incluant le virus de la rougeole, le Mumps virus, le Henipavirus
  • Famille des Rhabdoviridae – incluant le virus de la rage
• Non assigné
  • Famille des Arenaviridae - incluant le virus de la fièvre de Lassa
  • Famille des Bunyaviridae – incluant le Hantavirus, le virus de la fièvre Congo-Crimée
  • Famille des Orthomyxoviridae – incluant les virus de la grippe
  • Genres non assignés:
    • Genre Deltavirus
    • Genre Nyavirus - includes Nyamanini and Midway viruses
    • Genre Ophiovirus
    • Genre Tenuivirus
    • Genre Varicosavirus

Groupe IV - Virus à ARN simple brin à polarité positive (ssRNA)

• Ordre des Nidovirales
  • Famille des Arteriviridae
  • Famille des Coronaviridae – incluant le Coronavirus, Syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS)
  • Famille des Roniviridae
• Non assignées
  • Famille des Astroviridae
  • Famille des Barnaviridae
  • Famille des Bromoviridae
  • Famille des Caliciviridae – incluant le virus de Norwalk
  • Famille des Closteroviridae
  • Famille des Comoviridae
  • Famille des Dicistroviridae
  • Famille des Flaviviridae – incluant le virus de la Fièvre jaune, le Virus du Nil occidental, Virus de l'hépatite C, le virus de la Dengue
  • Famille des Flexiviridae
  • Famille des Leviviridae
  • Famille des Luteoviridae – incluant le Barley yellow dwarf virus
  • Famille des Marnaviridae
  • Famille des Narnaviridae
  • Famille des Nodaviridae
  • Famille des Picornaviridae – incluant le Poliovirus, le Rhinovirus, le virus de l’Hépatite A
  • Famille des Potyviridae
  • Famille des Sequiviridae
  • Famille des Tetraviridae
  • Famille des Togaviridae - incluant le virus de la rubéole, le virus de la Ross River, le Virus de Sindbis, le virus du Chikungunya
  • Famille des Tombusviridae
  • Famille des Tymoviridae
  • Genres non assignés
    • Genre des Benyvirus
    • Genre des Cheravirus
    • Genus des Furovirus
    • Genre des Hepevirus – incluant le virus de l’hépatite E
    • Genre des Hordeivirus
    • Genre des Idaeovirus
    • Genre des Ourmiavirus
    • Genre des Pecluvirus
    • Genre des Pomovirus
    • Genre des Sadwavirus
    • Genre des Sobemovirus
    • Genre des Tobamovirus – incluant le Virus de la mosaïque du tabac
    • Genre des Tobravirus
    • Genre des Umbravirus