Enterobacteriaceae - Définition
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Introduction
| Entérobactéries | |||||||||
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| Classification | |||||||||
| Règne | Bacteria | ||||||||
| Embranchement | Proteobacteria | ||||||||
| Classe | Gamma Proteobacteria | ||||||||
| Ordre | Enterobacteriales | ||||||||
| Famille | |||||||||
| Enterobacteriaceae — auteur incomplet —, date à préciser | |||||||||
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Les entérobactéries (Enterobacteriaceae) constituent l'une des plus importantes familles de bactéries, autant du point de vue quantitatif (plus d'une quarantaine de genres) que du point de vue qualitatif. Elle regroupe ainsi de nombreux genres, très ubiquitaires, et ceux-ci sont fréquemment rencontrés en pathologie infectieuse ainsi que dans les bio-industries (fermentation de fromages et produits laitiers, alcools, traitements médicaux supplétifs, production de toxines à usage cosmétique, industrie pharmaceutique pour la fabrication d’agents antiviraux, analyse biologique de prélèvements médicaux ou vétérinaires pour isoler en culture les agents pathogènes, un grand nombre d’industries pour effectuer des mesures de niveau de toxicité biologique...).
Définition
On définit classiquement les entérobactéries par 7 critères (mais il faut faire attention, avec les remaniements de familles issues des nouvelles méthodes de la taxonomie, certains genres, ne répondant pas forcément à tous ces critères, font aujourd'hui partie de cette famille) :
- Bacilles Gram- de dimension moyenne (coccobacille, souvent polymorphe)
- Non exigeants (culture facile)
- Oxydase négative. Attention à Stenotrophomonas maltophilia et Burkholderai cepacia complex qui sont Oxydase + mais en 3 minutes: ce sont deux bactéries aérobies strictes classées dans le genre Pseudomonas sensu lato.
- Nitrate réductase + (capables de réduire les nitrates en nitrites)
- Aéro-anaérobies facultatifs (capables de pousser en présence ou en absence de dioxygène)
- Voie fermentaire de dégradation du glucose (avec ou sans production de gaz)
- Immobiles ou mobiles par ciliature péritriche (très rares exceptions : Plesiomonas, ciliature polaire)
- Non sporulés
- Certains sont thermodépendants et ne poussent pas à 37°C tels que Hafnia alvei, Yersinia enterolitica...
Les différences entre les nombreux genres et espèces viennent de critères plus précis, comme la fermentation de différents sucres, la production ou non de sulfures, la présence ou l'absence d'enzymes du métabolisme (β-galactosidase, désaminases, décarboxylases), le type de fermentation (butan-2,3-diol ou acides mixtes). Ces critères permettent de regrouper les différents genres en « groupes », rendant les démarches d'identification plus méthodiques et plus aisées, mais qui ne correspondent pas forcément à des réalités de proximité phylogénétique (puisque ce sont des critères uniquement phénotypiques, comme l'ancienne classification scientifique).
il serait bien de marquer les milieux de culture spécifiques ou non de la famille Enterobacteriaceae. Après la détermination de la famille des entérobactériaceae, Une galerie de famille est necessaire pour déterminer le genre et l'espèce. galerie de famille pour identification : Milieu VF (viande foie), 2 Hugh Leifson + glucose, 1 Hajna Kligler et une galerie d'identification Api20E.
Caractères bactériologiques
Tous ces germes ont une morphologie identique : bâtonnets Gram -, de taille et de forme variable. Certains possèdent une capsule. La définition des entérobactéries repose sur les critères suivants : bacilles Gram négatifs, immobiles ou mobiles par cils péritriches, aérobies - anaérobies facultatifs, attaquant le glucose par voie fermentaire, dépourvus d'oxydase et réduisant les nitrates.
Les genres et les espèces sont différenciés sur la base de caractères biochimiques étudiés sur des milieux rassemblés dans la "galerie d'identification" (Fermentation des sucres ; décarboxylation d'acides aminés ; production d'indole, d'acétoine, d'H2S ; désamination de la phényl-alanine ; utilisation du citrate ; etc...). Certains caractères biochimiques particuliers permettent de définir des biotypes à l'intérieur d'une espèce, par ex. salmonella typhi, biotype xylose + et biotype xylose - ; cette distinction peut avoir de l'intérêt sur le plan épidémiologique.
