En 2008, le parcours complet de la ligne demande trente-trois minutes. Comme sur toutes les principales lignes du métro de Paris, le premier départ a lieu de la tête de ligne à 5 h 30. Toutefois, dans le sens est-ouest, une première circulation a lieu au départ de Place d'Italie à 5 h 30 qui précède de dix minutes la première rame venant de Nation. Le dernier départ a lieu de Charles de Gaulle - Étoile à 0 h 41 et de Nation à 0 h 42. Il est fixé respectivement à 1 h 42 et à 1 h 44 les nuits des vendredis aux samedis, des samedis aux dimanches et des veilles de fête aux jours de fête.
L'intervalle moyen entre les rames est de deux à quatre minutes en journée, de six à huit minutes en extrême soirée, de quatre à six minutes le dimanche en journée et de dix minutes les nuits des vendredis aux samedis, des samedis aux dimanches et des veilles de fête aux jours de fête après 0 h 30 (après 1 h 15 les nuits des vendredis aux samedis).
En 1974, la ligne est équipée des métros sur pneus MP 73 qui remplacent l'ancien matériel Sprague-Thomson, afin de diminuer les nuisances sonores. En octobre 1996, la ligne reçoit son premier MP 73 rénové (6529), puis à partir de 1998, progressivement, le reste du parc. Actuellement (août 2010), la ligne 11 utilise également un MP 73.
On distingue deux catégories de personnel : les agents en station et les agents de conduite. Les agents de station ont pour mission de tenir la caisse, d'assurer le contrôle des voyageurs ainsi que la gestion des lieux, la vérification des installations ou d'autres tâches à définir selon les besoins du service. Quelques agents sont par ailleurs détachés pour la durée du service afin d'assurer les relèves de caisses. Les conducteurs assurent la marche des rames. Le service est assuré sur trois roulements de travail (jour, mixte, nuit).
La tarification de la ligne est identique à celle en vigueur sur tout le reste du réseau et accessible avec les mêmes abonnements. Un ticket t+ permet un trajet simple quelle que soit la distance, avec une ou plusieurs correspondances possibles avec les autres lignes de métro ainsi que le RER, mais uniquement dans Paris intra-muros pour ce dernier.
Le financement du fonctionnement de la ligne (entretien, matériel et charges de personnel) est assuré par la RATP. Cependant, les tarifs des billets et abonnements dont le montant est limité par décision politique, ne couvrent pas les frais réels de transport. Le manque à gagner est compensé par l'autorité organisatrice, le Syndicat des transports d'Île-de-France (STIF), présidé depuis 2005 par le président du Conseil régional d'Île-de-France et composé d'élus locaux. Il définit les conditions générales d'exploitation ainsi que la durée et la fréquence des services. L'équilibre financier du fonctionnement est assuré par une dotation globale annuelle aux transporteurs de la région grâce au versement transport payé par les entreprises et aux contributions des collectivités publiques.
La ligne 6 est une ligne du réseau parisien au trafic assez élevé ; le nombre total de voyageurs transportés représente environ les deux-tiers de la fréquentation de la ligne 1 et plus du double des lignes 10 et ligne 11. De 1992 à 2004, le trafic est en augmentation de 10,2 %, ce qui place la ligne en cinquième position en termes de croissance sur le réseau (hors ligne 14).
Année | 1992 | 1993 | 1994 | 1995 | 1996 | 1997 | 1998 | 1999 | 2000 | 2001 | 2002 | 2003 | 2004 |
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Nombre de voyageurs | 91,3 | 89,9 | 90,3 | 80,1 | 85,1 | 86,1 | 89,6 | 89,6 | 96,0 | 98,2 | 99,6 | 97,1 | 100,7 |
Les deux stations les plus fréquentées desservies par la ligne sont (en trafic annuel, toutes lignes incluses) Montparnasse - Bienvenüe (29,46 millions de voyageurs) et Place d'Italie (16,10 millions). En 1998, le trafic quotidien atteint 309 260 voyageurs en moyenne chaque jour ouvrable, 199 685 le samedi et 123 319 le dimanche.